javafxパッケージのネイティブバンドルを作成したexeファイルのアイコンをチャンスにしようとしていますが、デフォルトのアイコンがまだ含まれています。提案してください
primaryStage.getIcons().add(FileUtility.loadImage("icon.png"));
タイトルバーとタスクバーのアイコンを変更するだけです。
ico ファイルは引き続き生成され、exe ファイルのアイコンはデフォルトのままです。
また、プロジェクトのプロパティ->展開->アイコンでアイコンを割り当てようとしましたが、役に立ちませんでした