@Brandon Bertelsen が素晴らしい回答を投稿したようです。元の投稿に記載されている追加の詳細に対応するコードをいくつか追加したいと思います。
- データを再形成し、ヘルス ステータスを にマップすると
fill
、ggplot によって凡例が自動的に作成されます。
scale_fill_manual()
元の投稿に記載されている正確なグレーを取得するために使用することをお勧めします。
theme_bw()
は、プロットを白黒ですばやく表示するための便利な関数です。
- 因子レベル/色のプロット順序は、
levels
引数 で目的の順序を指定することによって制御できますfactor()
。
- このデータ セットには、(積み上げではなく) 覆い隠された棒グラフを使用すると、いくつかの利点がある場合があります。
library(reshape2)
library(ggplot2)
x <- as.data.frame(list(variable=c("QUAG", "QUKE", "QUCH"),
alive=c(627, 208, 109), infected=c(102, 27, 0),
dead=c(133, 112, 12), sod.dead=c(49, 8, 0)))
# Put data into 'long form' with melt from the reshape2 package.
dat = melt(x, id.var="variable", variable.name="status")
head(dat)
# variable status value
# 1 QUAG alive 627
# 2 QUKE alive 208
# 3 QUCH alive 109
# 4 QUAG infected 102
# 5 QUKE infected 27
# 6 QUCH infected 0
# By manually specifying the levels in the factor, you can control
# the stacking order of the associated fill colors.
dat$status = factor(as.character(dat$status),
levels=c("sod.dead", "dead", "infected", "alive"))
# Create a named character vector that relates factor levels to colors.
grays = c(alive="gray85", dead="gray65", infected="gray38", sod.dead="black")
plot_1 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) +
theme_bw() +
geom_bar(position="stack") +
scale_fill_manual(values=grays)
ggsave(plot=plot_1, filename="plot_1.png", height=5, width=5)

# You may also want to try a dodged barplot.
plot_2 = ggplot(dat, aes(x=variable, y=value, fill=status)) +
theme_bw() +
geom_bar(position="dodge") +
scale_fill_manual(values=grays)
ggsave(plot=plot_2, filename="plot_2.png", height=4, width=5)
