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期待される出力を取得するにはどうすればよいですか

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またはそれらの行のいくつかの順列？

ランクテスト.c

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
int main(int argc, char *argv[]){
    MPI_Init(NULL, NULL);
    int world_rank;
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
    int world_size;
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
    printf("rank %d\n", world_rank);
    printf("size %d\n", world_size);
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

コンパイルと実行

tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpicc ranktest.c
tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpirun -np 2 ./a.out 
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別のホストの場合：

tsbertalan@stamp:~$ mpicc ranktest.c
tsbertalan@stamp:~$ mpirun -np 2 ./a.out 
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私はもう試した

tsbertalan@hustlenbustle:~$ sudo aptitude reinstall openmpi-bin libopenmpi-dev

しかし、何も変わりませんでした。/etc/openmpi/openmpi-default-hostfileと/etc/openmpi/openmpi-mca-params.confの両方に、両方のホストに関するコメントしか含まれていません。ここで何が違うのでしょうか？

に変更するMPI_Init(&argc, &argv)か、あるいは、変更してint main()も何も起こりません。

user3469194のおかげで本当の問題：

linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude remove libopenmpi-dev mpich2
linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude install libmpich2-dev openmpi-bin
linuxmint@linuxmint ~ $ mpicc ranktest.c
linuxmint@linuxmint ~ $ mpirun -np 2 ./a.out
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linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude remove libmpich2-dev openmpi-bin
linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude install libopenmpi-dev mpich2
linuxmint@linuxmint ~ $ mpicc ranktest.c
linuxmint@linuxmint ~ $ mpirun -np 2 ./a.out
[linuxmint:16539] [[INVALID],INVALID] ORTE_ERROR_LOG: A system-required executable either could not be found or was not executable by this user in file ../../../../../../orte/mca/ess/singleton/ess_singleton_module.c at line 357

（さらにはるかに）

いくつかの提案への回答:(このgithubリポジトリ を参照してください。2012年12月1日にコミットします。）

MPI_Init（）の前にworld_rankとworld_sizeの定義を移動してみてください、それは何かを変更しますか？

当然、これはあまりうまく機能しません：

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ git checkout 7b5e229 ranktest.c
(reverse-i-search)`clean': tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ make ^Cean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ make clean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
rm -f heat_serial heat_omp heat_mpi heat_serial_O* ranktest
mpicc ranktest.c -o ranktest
*** An error occurred in MPI_Comm_rank
*** before MPI was initialized
*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (your MPI job will now abort)
[perrin:15206] Abort before MPI_INIT completed successfully; not able to guarantee that all other processes were killed!
*** An error occurred in MPI_Comm_rank
*** before MPI was initialized
*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (your MPI job will now abort)
[perrin:15207] Abort before MPI_INIT completed successfully; not able to guarantee that all other processes were killed!
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ git checkout HEAD ranktest.c

または、自宅のコンピューターで：

tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ git checkout 7b5e229 ranktest.c
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ vim ranktest.c 
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ make clean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
rm -f heat_serial heat_omp heat_mpi heat_serial_O* ranktest
mpicc ranktest.c -o ranktest
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ git checkout HEAD ranktest.c

これはほとんどの場合、あるMPIでコンパイルされたプログラムを別のMPirunで実行する際の問題です。最初のマシン（hustlenbustle）にもmpich2がインストールされていますか？物事は道のどこに現れますか？特に、との結果は何which mpiccですかwhich mpirun？

各コンピューターで、各試行の前に再コンパイルしています。私は先に進んで、これのメイクターゲットを作りました。ただし、リクエストに応じて：

tsbertalan@hustlenbustle:~$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
tsbertalan@hustlenbustle:~$ which mpirun
/usr/bin/mpirun

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ which mpirun
/usr/bin/mpirun

そして、シグルについては、hnbとperrinの適性検索の出力を次に示します。他に何か検索する必要があるかどうか教えてください。

Open MPIで、次のコマンドでバージョンを出力しますmpirun -V。印刷されない場合mpiexec (OpenRTE) 1.x.x.は、実行時間の不一致がある可能性があります。

tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpirun -V
mpirun (Open MPI) 1.4.3

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ mpirun -V
mpirun (Open MPI) 1.4.1

ただし、テストごとに再コンパイルしています。

おそらくsudo aptitude reinstall SOMETHING役立つかもしれませんか？

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2 に答える 2

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このコードは、コンピューターにあるバージョンのmpic.cで見つかりました（mpiを含む新しいパッケージをインストールしたときに問題が発生していました）。お使いのコンピュータにはこのようなものがあり、他のホストには正しいバージョンがあるようです。

int MPI_Comm_rank( MPI_Comm comm, int *rank)
{
  *rank=0;
  return 0;
}

ご覧のとおり、ランクは常に0に設定されています（同様のサイズ関数はおそらく変数を1に設定しています）。

于 2013-08-06T22:48:28.293 に答える
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私もこの問題を抱えていました。問題は、mpiccがOpenMPI（これを確認するには、mpicc -vを実行するだけ）であるのに対し、mpirunはMPICH2（mpirun -V）であるということでした。MPICH2をアンインストールするだけで解決しました。

于 2014-03-27T15:10:53.757 に答える