MongoDb のインストール手順によると、それは非常に簡単なはずです。
Mongodb は接続を待機するコンソール アプリケーションとして起動するため、アプリの起動時に mongodb hiddenを実行する必要があります。すべての mongodb ファイルがアプリケーション ファイルとともに適切な場所にあり、データベース ファイルが正しいディレクトリにあると常に想定しています)。
アプリが終了したら、プロセスを強制終了する必要があります。
この例では、正しいパスを設定する必要があります。
//starting the mongod server (when app starts)
ProcessStartInfo start = new ProcessStartInfo();
start.FileName = dir + @"\mongod.exe";
start.WindowStyle = ProcessWindowStyle.Hidden;
start.Arguments = "--dbpath d:\test\mongodb\data";
Process mongod = Process.Start(start);
//stopping the mongod server (when app is closing)
mongod.Kill();
mongod の構成と実行の詳細については、こちらを参照してください。