awk - awkを使用して小文字を大文字の「C」に置き換える方法は?

Question

タンパク質配列を含むテキスト ファイルがあります。すべての小文字を大文字の「C」に置き換えたいと思います。awkでこれを行うにはどうすればよいですか?

>1CHE
aHKLbMaHc
>2HV3
PNMRrYnf
>5GH3
LKDeVmqQ

desired output

>1CHE
CHKLCMCHC
>2HV3
PNMRCYCC
>5GH3
LKDCVCCQ

Answer 1

echo 'changecase' | tr [:lower:] C

Answer 2

私はこれに使用sedします：

sed '/^>/!s/[a-z]/C/g' file.txt

をご希望の場合はawk、こちらをご覧ください:

awk '!/^>/ { gsub(/[a-z]/, "C") }1' file.txt

結果：

>1CHE
CHKLCMCHC
>2HV3
PNMRCYCC
>5GH3
LKDCVCCQ