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matplotlibを使用して、画像シリーズ内の選択されたスライスをインタラクティブに削除するコードを少し書き込もうとしています。「更新」ボタンが選択されたときに削除されるインデックスの数を格納する「削除」ボタンを作成しました。ただし、現在、スライダーウィジェットの範囲をリセットできません。つまり、valmaxから削除されたスライスの数を削除できません。この問題のpythonicソリューションは何ですか?

これが私のコードです:

import dicom
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from matplotlib.widgets import Slider, Button

frame = 0
#store indices of slices to be deleted
delete_list = []


def main():

    data = np.random.rand(16,256,256)
    nframes = data.shape[0]

    raw_dicom_stack = []
    for x in range (nframes):
        raw_dicom_stack.append(data[x,:,:])

    #yframe = 0

    # Visualize it
    viewer = VolumeViewer(raw_dicom_stack, nframes)
    viewer.show()

class VolumeViewer(object):
    def __init__(self, raw_dicom_stack, nframes):

        global delete_list

        self.raw_dicom_stack = raw_dicom_stack
        self.nframes = nframes
        self.delete_list = delete_list

        # Setup the axes.
        self.fig, self.ax = plt.subplots()
        self.slider_ax = self.fig.add_axes([0.2, 0.03, 0.65, 0.03])
        self.delete_ax = self.fig.add_axes([0.85,0.84,0.1,0.04])
        self.update_ax = self.fig.add_axes([0.85,0.78,0.1,0.04])
        self.register_ax = self.fig.add_axes([0.85,0.72,0.1,0.04])
        self.add_ax = self.fig.add_axes([0.85,0.66,0.1,0.04])

        # Make the slider
        self.slider = Slider(self.slider_ax, 'Frame', 1, self.nframes, 
                            valinit=1, valfmt='%1d/{}'.format(self.nframes))
        self.slider.on_changed(self.update)

        #Make the buttons
        self.del_button = Button(self.delete_ax, 'Delete')
        self.del_button.on_clicked(self.delete)

        self.upd_button = Button(self.update_ax, 'Update')
        self.upd_button.on_clicked(self.img_update)

        self.reg_button = Button(self.register_ax, 'Register')

        self.add_button = Button(self.add_ax, "Add")

        # Plot the first slice of the image
        self.im = self.ax.imshow(np.array(raw_dicom_stack[0]))

    def update(self, value):
        global frame
        frame = int(np.round(value - 1))

        # Update the image data
        dat = np.array(self.raw_dicom_stack[frame])
        self.im.set_data(dat)

        # Reset the image scaling bounds (this may not be necessary for you)
        self.im.set_clim([dat.min(), dat.max()])

        # Redraw the plot
        self.fig.canvas.draw()

    def delete(self,event):
        global frame
        global delete_list

        delete_list.append(frame)
        print 'Frame %s has been added to list of slices to be deleted' %str(frame+1)
        print 'Please click update to delete these slices and show updated image series \n'

        #Remove duplicates from delete list

    def img_update(self,event):
        #function deletes image stacks and updates viewer
        global delete_list

        #Remove duplicates from list and sort into numerical order
        delete_list = list(set(delete_list))
        delete_list.sort()

        #Make sure delete_list is not empty
        if not delete_list:
            print "Delete list is empty, no slices to delete"
        #Loop through delete list in reverse numerical order and remove slices from series
        else:
            for i in reversed(delete_list):
                self.raw_dicom_stack.pop(i)
                print 'Slice %i removed from dicom series \n' %(i+1)

        #Can now remove contents from delete_list
        del delete_list[:]
        #Update slider range
        self.nframes =  len(self.raw_dicom_stack)


    def show(self):
        plt.show()

if __name__ == '__main__':
    main()
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2 に答える 2

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スライダーの範囲を更新するには、スライダーの最小値と最大値を直接設定します。

slider.valmin = 3
slider.valmax = 7

この変更をスライダー軸に反映するには、軸の制限を設定する必要があります。

slider.ax.set_xlim(slider.valmin,slider.valmax)

完全な例では、任意の数字を入力するvalminと、スライダーのがその値に変わります。

import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.widgets

fig, (ax,sliderax) = plt.subplots(nrows=2,gridspec_kw=dict(height_ratios=[1,.05]))

ax.plot(range(11))
ax.set_xlim(5,None)
ax.set_title("Type number to set minimum slider value")
def update_range(val):
    ax.set_xlim(val,None)

def update_slider(evt):
    print(evt.key)
    try:
        val = int(evt.key)
        slider.valmin = val
        slider.ax.set_xlim(slider.valmin,None)
        if val > slider.val:
            slider.val=val
            update_range(val)
        fig.canvas.draw_idle()
    except:
        pass

slider=matplotlib.widgets.Slider(sliderax,"xlim",0,10,5)
slider.on_changed(update_range)

fig.canvas.mpl_connect('key_press_event', update_slider)

plt.show()
于 2017-11-28T17:37:22.697 に答える
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スライダーには範囲( api )を更新する方法がないようです。スライダーの範囲を[0,1]に設定して実行することをお勧めします

frame = int(self.nframes * value)

やや関連性のあるメモとしてframe 、インスタンス変数をグローバル変数ではなくデータ属性にしたと思います(チュートリアル)。

于 2012-11-21T14:53:17.527 に答える