r - header=FALSE read.table() の「レベル」

Question

ヘッダー ラベルを名前ではなくマトリックスのエントリとして使用するために、引数 header=FALSE を指定して read.table を使用しました。

ヘッダー エントリを要素として呼び出すと、次のような内容が得られます。

TCGA_20_0987_01A_02R_0434_01 21199 レベル: 10.0039251940782 10.0057778066803 ... TCGA_20_0987_01A_02R_0434_01

さて、最初の値 (TCGA_20...) が必要です。「レベル」エントリはどこから来て、それらは何ですか?また、ヘッダー ラベルのみがマトリックス要素として表示されるようにするにはどうすれば回避できますか?

Answer 1

header=FALSE を指定すると、最初の行がデータとして読み込まれます。最初の行がすべてテキストの場合、変数はすべて因子変数になります ( .... 必要なものではありません)。header=TRUE で試してください。そのファイルの最初の行は列名だと思います。そのテキスト ファイルの最初の数行を貼り付けることができれば、何が起こっているのかがより明確になります。特定の列を指定されたクラスとして強制的に読み取るメソッドがありますが、最初に何が必要かを確認する必要があります。