指定された時点でアプリケーションプールがリサイクルされないという問題が発生しています（シャットダウンされている可能性があります。これは質問の一部です）。主に.net4mvcサイトとwcfサービスを実行している約20のアプリプールがあります。すべてのアプリプールは、同じ特定の時間にリサイクルするように構成されており、そのようなイベントだけをログに記録するように構成されています。イベントビューアを確認したところ、実際にリサイクルされたのは2つか3つだけでした。問題は、アプリケーションによって明らかになり、時々奇妙な方法で動作しているようです。
シャットダウンされているアプリケーションプールは、ワーカープロセスを再開したときに、アプリケーションプールのリサイクルを構成しますか？