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MPI と C を使用して正方行列をベクトルで乗算しようとしています。MPI_Allgather を使用して、行列のすべての部分をすべてのプロセスに送信する必要があります。これは私がこれまでに持っているものです

#include "mpi.h" 
#include <stdlib.h>
#include <stdio.h>
#include <math.h>
#include <string.h>
#include <time.h>
#define DIM 500

int main(int argc, char *argv[])
{

      int i, j, n; 
      int nlocal;        /* Number of locally stored rows of A */ 
      double *fb;
      double a[DIM*DIM], b[DIM], x[DIM];     /* Will point to a buffer that stores the entire vector b */ 
      int npes, myrank; 
      MPI_Status status; 

       MPI_Init(&argc,&argv);

     /* Get information about the communicator */ 
     MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &myrank);
     MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &npes);  

     /* Allocate the memory that will store the entire vector b */ 
     fb = (double*)malloc(n*sizeof(double)); 

     nlocal = n/npes; 

     /* Gather the entire vector b on each processor using MPI's ALLGATHER operation */ 
     MPI_Allgather(b, nlocal, MPI_DOUBLE, fb, nlocal, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD); 

     /* Perform the matrix-vector multiplication involving the locally stored submatrix */ 
     for (i=0; i<nlocal; i++) { 
       x[i] = 0.0; 
       for (j=0; j<n; j++) 
         x[i] += a[i*n+j]*fb[j]; 
     } 


     free(fb);

     MPI_Finalize();   
}//end main

OK今それは動作します! コンパイルはできますが、mpi allgather 内部エラーが発生します。私が試した他のソリューションでもこれを取得しました。

Fatal error in MPI_Allgather: Internal MPI error!, error stack:
MPI_Allgather(961).......: MPI_Allgather(sbuf=0xa1828, scount=407275437, MPI_DOU                                                                                                                BLE, rbuf=0xf61d0008, rcount=407275437, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Allgather_impl(807).:
MPIR_Allgather(766)......:
MPIR_Allgather_intra(560):
MPIR_Localcopy(357)......: memcpy arguments alias each other, dst=0xb8513d70 src                                                                                                                =0xa1828 len=-1036763800
Fatal error in MPI_Allgather: Internal MPI error!, error stack:
MPI_Allgather(961).......: MPI_Allgather(sbuf=0xa1828, scount=407275437, MPI_DOU                                                                                                                BLE, rbuf=0xf61d0008, rcount=407275437, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Allgather_impl(807).:
MPIR_Allgather(766)......:
MPIR_Allgather_intra(560):
MPIR_Localcopy(357)......: memcpy arguments alias each other, dst=0x3cb9b840 src                                                                                                                =0xa1828 len=-1036763800
Fatal error in MPI_Allgather: Internal MPI error!, error stack:
MPI_Allgather(961).......: MPI_Allgather(sbuf=0xa1828, scount=407275437, MPI_DOU                                                                                                                BLE, rbuf=0xf61d0008, rcount=407275437, MPI_DOUBLE, MPI_COMM_WORLD) failed
MPIR_Allgather_impl(807).:
MPIR_Allgather(766)......:
MPIR_Allgather_intra(560):
MPIR_Localcopy(357)......: memcpy arguments alias each other, dst=0x7a857ad8 src                                                                                                                =0xa1828 len=-1036763800

誰でも私を助けることができますか？

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1 つの次元 (主な行または列) を使用して 2 次元配列にアクセスしている場合は、a[DIM*DIM]代わりに2 次元配列を割り当てa[DIM][DIM]て、線形にアクセスすることができます。このソリューションは私のために働いています。

于 2012-12-08T09:27:34.120 に答える