私は現在、母集団データのデータ分析を行っているため、パラメーター係数のテーブルで標準誤差を報告しても、統計的に意味がありません。私はかなりの検索を行いましたが、xtable出力をカスタマイズして削除する方法が見つかりません。誰かが私を正しい方向に向けることができますか？
どうもありがとう、私はこれを軽く投稿しませんでした。明らかなことなら、時間を無駄にしてしまったことをお詫びします！
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だから私の（他の）長い間答えた後...これもうまくいく：
xtable(summary(model1)$coefficients[,c(1,3,4)])
またはより一般的に：
sm <- summary(SomeModel)
SE.indx <- which(colnames(sm$coefficients) == "Std. Error") # find which column is Std. Error (usually 2nd)
sm$coefficients <- sm$coefficients[, -SE.indx] # Remove it
xtable(sm$coefficients) # call xtable on just the coefficients table
結果：
% latex table generated in R 2.15.1 by xtable 1.7-0 package
% Sun Dec 9 00:01:46 2012
\begin{table}[ht]
\begin{center}
\begin{tabular}{rrrr}
\hline
& Estimate & t value & Pr($>$$|$t$|$) \\
\hline
(Intercept) & 29.80 & 30.70 & 0.00 \\
crim & -0.31 & -6.91 & 0.00 \\
age & -0.09 & -6.50 & 0.00 \\
\hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}
于 2012-12-09T05:02:37.363 に答える
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help(lm) の最初の例を使用します。
xtable(as.matrix(coef(lm.D9)))
% latex table generated in R 2.15.2 by xtable 1.7-0 package
% Sat Dec 8 19:53:09 2012
\begin{table}[ht]
\begin{center}
\begin{tabular}{rr}
\hline
& x \\
\hline
(Intercept) & 5.03 \\
groupTrt & -0.37 \\
\hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}
これが単なるサンプルではなく母集団の説明である場合、std erros を使用しないことに同意しました。ただし、その理由から、p 値または t 統計量を残したくはありません。そのため、係数のみを含めました。要約係数行列から標準誤差列のみを削除するには:
xtable( coef(summary(lm.D9))[,-2] )
% latex table generated in R 2.15.2 by xtable 1.7-0 package
% Sat Dec 8 21:02:17 2012
\begin{table}[ht]
\begin{center}
\begin{tabular}{rrrr}
\hline
& Estimate & t value & Pr($>$$|$t$|$) \\
\hline
(Intercept) & 5.03 & 22.85 & 0.00 \\
groupTrt & -0.37 & -1.19 & 0.25 \\
\hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}
于 2012-12-09T03:55:07.660 に答える
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見ると、削除したい値があることがstr(summary(Model1))わかります。$coefficientsStd. Error
lesserSummary <- function(x) {
## returns same as summary(x), but with "Std. Error" remove from coefficients.
## and class of object is "modifiedSummary"
# grab the summary
sm <- summary(x)
# find which column is std error
SE.indx <- which(colnames(sm$coefficients) == "Std. Error")
# remove it
sm$coefficients <- sm$coefficients[, -SE.indx]
# give it some class
class(sm) <- "modifiedSummary"
# return it
sm
}
xtable.modifiedSummary <-
function (x, caption = NULL, label = NULL, align = NULL, digits = NULL, display = NULL, ...) {
# x is a modifiedSummary object
# This function is a modification of xtable:::xtable.summary.lm
# Key Difference is simply the number of columns that x$coef is expected to have
# (Here 3. Originally 4)
x <- data.frame(x$coef, check.names = FALSE)
class(x) <- c("xtable", "data.frame")
caption(x) <- caption
label(x) <- label
align(x) <- switch(1 + is.null(align), align, c("r", "r", "r", "r"))
digits(x) <- switch(1 + is.null(digits), digits, c(0, 4, 2, 4))
display(x) <- switch(1 + is.null(display), display, c("s", "f", "f", "f"))
return(x)
}
xtable_mod <- function(x) {
# Wrapper function to xtable.modified summary, calling first lesserSummary on x
xtable(lesserSummary(x))
}
例：
xtable_mod(model1)
% latex table generated in R 2.15.1 by xtable 1.7-0 package
% Sat Dec 8 23:44:54 2012
\begin{table}[ht]
\begin{center}
\begin{tabular}{rrrr}
\hline
& Estimate & t value & Pr($>$$|$t$|$) \\
\hline
(Intercept) & 29.8007 & 30.70 & 0.0000 \\
crim & -0.3118 & -6.91 & 0.0000 \\
age & -0.0896 & -6.50 & 0.0000 \\
\hline
\end{tabular}
\end{center}
\end{table}
以下は、上記の結論に至るまでの手順です。
xtable の呼び出しを変更できる可能性がありますが、最初に少し従う必要があります。xtable のソースを調べることから始めます。
xtable
# function (x, caption = NULL, label = NULL, align = NULL, digits = NULL,
# display = NULL, ...)
# {
# UseMethod("xtable")
# }
# <environment: namespace:xtable>
への呼び出しがあるだけであることがわかりますUseMethod()。それでは、どのメソッドが利用可能か見てみましょう:
methods(xtable)
# [1] xtable.anova* xtable.aov* xtable.aovlist*
# [4] xtable.coxph* xtable.data.frame* xtable.glm*
# [7] xtable.lm* xtable.matrix* xtable.prcomp*
# [10] xtable.summary.aov* xtable.summary.aovlist* xtable.summary.glm*
# [13] xtable.summary.lm* xtable.summary.prcomp* xtable.table*
# [16] xtable.ts* xtable.zoo*
いくつかあります。アスタリスク*が付いているものは見えないことに注意してください。
呼び出されるメソッドは、呼び出しているオブジェクトのクラスによって決まりますxtable。
出力が次のようになるとしましょうModel1 。そのクラスを見てみましょう。
class(Model1)
# [1] "lm"
したがって、見たいソースはxtable.lm.
xtable.lm
# Error: object 'xtable.lm' not found
エラー？そうです、見えないのです。そのため、パッケージ名にコロンを 3 つ付けて使用します。注: ヘルプ ファイルの通知を必ずお読みください ?":::"
xtable:::xtable.lm
# function (x, caption = NULL, label = NULL, align = NULL, digits = NULL,
# display = NULL, ...)
# {
# return(xtable.summary.lm(summary(x), caption = caption, label = label,
# align = align, digits = digits, display = display))
# }
# <environment: namespace:xtable>
最初の引数として aをxtable.lm 呼び出して渡すことに注意してください。ここで、 x はモデルです。xtable.summary.lmsummary(x)
したがって、調査する場所は 2 つ summaryあります。xtable.summary.lm
于 2012-12-09T03:30:36.540 に答える