python - Pythonのセルに3D分散データを配置するにはどうすればよいですか？

Question

3D空間に散在するデータのリストが3つあります。たとえば、次のようになります。

X、Y、Z

それぞれが座標を表し、一定の間隔内にあり、N個のデータが含まれています。しかし、私の問題は、互いに重なり合ってはならない一定のサイズのセルにデータを入れる方法を見つけることです。そのため、あるセルから別のセルへのデータの出現順序に応じて、Networkxを適用して複雑なネットワークを作成する必要があります。

私が使用できるツールまたは何か他のものを見つけるのを手伝ってくれることを願っています。