ClickOnce は、インストール ファイルを作成するための優れたツールです。しかし、MS SQL Server 2008 Express バージョンをインストールしたり、データベースのインスタンスを作成したり、データベース スクリプトを実行したりすることはできません。
MSI について調査しましたが、MSI の最新バージョンは 4.5 で、2 年以上前にリリースされたようで、マシンにインストールできません。
Microsoft Web Installer も使用しようとしました。ダウンロードできますが、プロジェクトのインストールに使用できません。