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16 列のデータ フレーム内の各数値を、各列の特定の数値で除算しようとしています。数値は、1 ～ 16 のデータ フレームとして格納され、1 ～ 16 は、より大きなデータ フレームの列 1 ～ 16 のサンプルに対応します。大きなスプレッドシートの各数値で除算し、出力を最終的なスプレッドシートに出力する必要がある列ごとに 1 つの数値があります。

これが私が始めているものの例です。分割するスプレッドシート。

            X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
1/2-SBSRNA4          4          2          2          6          7          6
A1BG                93         73         88         86         58         65
A1BG-AS1           123        103         96        128         46         57

スプレッドシートを割る数値

X131.478.1 1.0660880
X131.478.2 0.9104053
X131.NSC.1 0.8642545
X131.NSC.2 0.9611866
X166.478.1 0.9711406
X166.478.2 1.0560121

そして、期待される結果は、ここで行ったように必ずしも丸められるわけではありません。

    X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
1/2-SBSRNA4          3.75          2.19          2.31          6.24          7.20         5.68
A1BG                87.23         80.17         101.82         89.47         59.72         61.55
A1BG-AS1           115.37        113.13         111.07        133.16         47.36         53.97

データ フレーム mx2 = mx/sf を単純に分割してみました。mx は大きなデータ セットで、sf は分割する数値のデータ フレームです。sf データセットの最初の数字ですべてを割るように見えました。

除算の数値は、DESeq パッケージの一部である EstimateSizeFactors によって生成されました。

どんな助けでも素晴らしいでしょう。ありがとう！

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5 に答える 5

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sweepこのような操作には便利ですが、入力として行列が必要です。そのため、データ フレームを行列に変換し、操作を行ってから元に戻します。たとえば、行列の各列の各要素をmatvector の対応する値で除算したダミー データvec:

mat <- matrix(1:25, ncol = 5)
vec <- seq(2, by = 2, length = 5)

sweep(mat, 2, vec, `/`)

使用中、次のものがあります。

> mat
     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5]
[1,]    1    6   11   16   21
[2,]    2    7   12   17   22
[3,]    3    8   13   18   23
[4,]    4    9   14   19   24
[5,]    5   10   15   20   25
> vec
[1]  2  4  6  8 10
> sweep(mat, 2, vec, `/`)
     [,1] [,2]     [,3]  [,4] [,5]
[1,]  0.5 1.50 1.833333 2.000  2.1
[2,]  1.0 1.75 2.000000 2.125  2.2
[3,]  1.5 2.00 2.166667 2.250  2.3
[4,]  2.0 2.25 2.333333 2.375  2.4
[5,]  2.5 2.50 2.500000 2.500  2.5
> mat[,1] / vec[1]
[1] 0.5 1.0 1.5 2.0 2.5

データ フレームから変換するには、as.matrix(df)またはdata.matrix(df)を使用as.data.frame(mat)し、逆にします。

于 2012-12-12T01:05:38.537 に答える
6

データフレームがあるとしますdf:

> df
  a b   c
1 1 3 100
2 2 4 110

そして、各行を同じベクトル で除算しますvec。

> vec <- df[1,]
> vec
  a b   c
1 1 3 100

次にmapply、次のように使用できます。

> mapply('/', df, vec)
     a        b   c
[1,] 1 1.000000 1.0
[2,] 2 1.333333 1.1
于 2019-09-17T20:14:48.823 に答える
2

多様性のためだけに、あなたも使うことができますmapply

mx <- structure(list(X131.478.1 = c(4L, 93L, 123L), X131.478.2 = c(2L, 
73L, 103L), X131.NSC.1 = c(2L, 88L, 96L), X131.NSC.2 = c(6L, 
86L, 128L), X166.478.1 = c(7L, 58L, 46L), X166.478.2 = c(6L, 
65L, 57L)), .Names = c("X131.478.1", "X131.478.2", "X131.NSC.1", 
"X131.NSC.2", "X166.478.1", "X166.478.2"), class = "data.frame", row.names = c("1/2-SBSRNA4", 
"A1BG", "A1BG-AS1"))

sf <- structure(list(V1 = c(1.066088, 0.9104053, 0.8642545, 0.9611866, 
0.9711406, 1.0560121)), .Names = "V1", row.names = c("X131.478.1", 
"X131.478.2", "X131.NSC.1", "X131.NSC.2", "X166.478.1", "X166.478.2"
), class = "data.frame")


mapply(function(x, y) x * y, mx, t(sf))


    X131.478.1 X131.478.2 X131.NSC.1 X131.NSC.2 X166.478.1 X166.478.2
[1,]   4.264352   1.820811   1.728509    5.76712   6.797984   6.336073
[2,]  99.146184  66.459587  76.054396   82.66205  56.326155  68.640787
[3,] 131.128824  93.771746  82.968432  123.03188  44.672468  60.192690

しかし、これについては、ジョシュの答えの方が優れていると思います...そしてギャビンの答えはさらに優れています!

于 2012-12-12T01:03:41.597 に答える
0

あなたが使用することができますtransform

mx2 <- transform(mx, 
    X131.478.1=X131.478.1/sf["X131.478.1",1],
    X131.478.2=X131.478.2/sf["X131.478.2",1],
    etc
)

16 列で入力するのはかなり大変ですが、うまくいくはずです。

于 2012-12-12T00:53:08.757 に答える