重複の可能性:
R スクリプトでのコマンド ライン引数の解析
これは私の最初の投稿です。初心者の質問をしている場合や、既に回答されている場合は、よろしくお願いします。
ファイルを入力として受け取り、2 番目の列の連続するデータ ポイントの差を計算し、計算された差ポイントのヒストグラムをプロットする R スクリプトを作成しました。
すべて問題ありませんが、そのスクリプトがコマンドライン引数として入力を受け取るようにします。--args と --slave を試しましたが、うまくいきません! どうすれば達成できますか?? また、スクリプトは非常に遅くなります。2 つの for ループを使用して記述したため、50,000 行のファイルを処理するのに 10 分ほどかかりますが、awk では 30 秒程度で処理されます。これをスピードアップするためのトリックはありますか??
データは次のようになります。
CHROM POS
chr01 925
chr01 929
chr01 981
chr01 1008
chr01 1012
chr01 1042
chr01 1065
chr01 1255
chr01 1260
ありがとうございました。