次のリンクを検討してください。
https://code.google.com/p/android-apktool/wiki/KnownIssues
一番下に記載:</p>
一部の APK が通常の Android 標準に準拠していないことがわかりました。それらはおそらく変更された aapt を使用してビルドされたものであり、逆コンパイルはほぼ不可能です。これらの APK は「Magic」apk と呼ばれ、おそらくサポートされません。
では、どうすれば自分のアプリを保護できますか? に興味はmodified aapt
あるが、何から始めればよいか分からない。ありがとうございました。