複雑な多次元データの分析と視覚化の作成は複雑です。最良の視覚化は、ほとんどの場合、データが何であるか、およびデータ内にどのような関係が存在するかによって異なります。もちろん、データの視覚化を作成して、関係を表示および調査したいと考えていることでしょう。最終的に、これはさまざまな可能性を試すことに帰着します。
私のアドバイスは、データについて考え、次元を分割するための賢明な方法を見つけようとすることです。表面プロットやボクセル レンダリングなどの 3D プロットが必要な場合があります。個人的には、理解しやすく、他の人に伝えやすい 2D 表現を探す方が好きです。等高線図は、3D 情報を 2D 形式で表示するので優れています。一連の等高線図を並べて表示したり、タイムラプスで表示して 4 番目の次元を追加したりできます。ビジュアライゼーションをわかりやすく保ちながら、色を使用して次元を追加する創造的な方法もあります。これが最も重要なことです。
自分でコードを書きたいと思っているようです。という事は承知しています。これを行うにはかなりの労力が必要であり、後で効果的な視覚化ができなくなる可能性があります。私のアドバイスは次のとおりです。最初にビジュアライゼーションのプロトタイプを作成するのに役立つツールを使用してください。他のオプションがあると確信していますが、gnuplot を使用してある程度の成功を収めました。
データを適切に処理し、その意味を伝える方法を習得したら、優れた視覚化をコーディングできるようになります。
アップデート
ご提示いただいたデータをもとに提案させていただきます。ポイント密度マップが必要/必要であるかのように聞こえます。これらは地理情報システムでよく使用されますが、他の用途もあります。以前は使用したことがありませんが、基本的な考え方は、関数を使用して 3D 空間の密度を推定することです。密度は 4 番目の次元になります。以下の式のような比較的単純なもので十分な場合があります。
ポイント密度マップは、生の粒子データよりもスライス、要約、およびレンダリングが容易な場合があります。
私が分析したデータは別の性質のものであったため、この特定の方法は以前に使用したことがありません。うまくいけば、それは役に立ちます。
PS。以下のあなたのコメントを見たばかりですが、この情報があなたに役立つかどうかはわかりません. ただし、有用な情報である場合に備えて、とにかく更新を投稿しています。