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2D numpy 配列をポリゴンに変換したい。パフォーマンスは私にとって非常に重要ですが、C 拡張を作成することは避けたいと考えています。バイナリ アウトライン イメージは、浸食で作成できます。それから私はこれを見つけまし。速度が遅すぎて、侵食によって発生するスパイクに対応できませんでした。スパイク:

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私の最初の試み:

mat = mat.copy() != 0
mat = mat - scipy.ndimage.binary_erosion(mat)

vertices = np.argwhere(mat)
minx = vertices.min(axis=0)[0]
maxx = vertices.max(axis=0)[0]

vertices_sorted = {}
for x in xrange(minx - 1, maxx + 2):
    vertices_sorted[x] = []

for vertex in vertices:
    vertices_sorted[vertex[0]].append(vertex[1])

vertex_loop = [(minx, vertices_sorted[minx][0])]
while True:
    x, y = vertex_loop[-1]
    for column, row in ((x, y + 1), (x, y - 1), 
    (x + 1, y), (x + 1, y + 1), (x + 1, y - 1),
    (x - 1, y), (x - 1, y + 1), (x - 1, y - 1)):
        if row in vertices_sorted[column]:
            vertices_sorted[column].remove(row)
            vertex_loop.append((column, row))
            break
    else:
        vertex_loop.pop()

    if vertex_loop[-1] == vertex_loop[0]:
        break
return vertex_loop[:-1]

ほとんどの場合は機能しますが、十分に高速ではありません。私の 2 番目のコードはめったに機能しませんが、最初のコードよりも数倍遅いため、修正していません。

mat = mat.copy() != 0
mat = mat - scipy.ndimage.binary_erosion(mat)

xs, ys = np.nonzero(mat)
ys = np.ma.array(ys)

vertex_loop = [(xs[0], ys[0])]
ys[0] = np.ma.masked
while True:
    x, y = vertex_loop[-1]
    start = np.searchsorted(xs, x-1, side="left")
    end = np.searchsorted(xs, x+1, side="right")

    for i in xrange(start, end):
        if ys[i] == y or ys[i] == y + 1 or ys[i] == y - 1:
            vertex_loop.append((xs[i], ys[i]))
            ys[i] = np.ma.masked
            break
    else:
        if np.all(ys.mask):
            break
        else:
            vertex_loop.pop()
return vertex_loop

どうすればさらに速度を向上させることができますか?

編集: でこぼこのマスクされた配列は非常に遅いようです。この実装は、最初の実装とほぼ同じ速度です。

#import time
#t1 = time.time()
mat = mat.copy() != 0
mat = mat - scipy.ndimage.binary_erosion(mat)

xs, ys = np.nonzero(mat)
#t2 = time.time()
minx = xs[0]
maxx = xs[-1]

# Ketju pakosti käy läpi kaikki rivit minx:n ja maxx:n välissä, sillä se ON KETJU
xlist = range(minx - 1, maxx + 2)
# starts ja ends ovat dictit jotka kertovat missä slicessä x == key
tmp = np.searchsorted(xs, xlist, side="left")
starts = dict(zip(xlist, tmp))
tmp = np.searchsorted(xs, xlist, side="right")
ends = dict(zip(xlist, tmp))

unused = np.ones(len(xs), dtype=np.bool)
#t3 = time.time()
vertex_loop = [(xs[0], ys[0])]
unused[0] = 0
count = 0
while True:
    count += 1
    x, y = vertex_loop[-1]
    for i in xrange(starts[x - 1], ends[x + 1]):
        row = ys[i]
        if unused[i] and (row == y or row == y + 1 or row == y - 1):
            vertex_loop.append((xs[i], row))
            unused[i] = 0
            break
    else:
        if abs(x - xs[0]) <= 1 and abs(y - ys[0]) <= 1:
            break
        else:
            vertex_loop.pop()
#t4 = time.time()
#print abs(t1-t2)*1000, abs(t2-t3)*1000, abs(t3-t4)*1000
return vertex_loop

私が見つけられなかった scipy でこれを行う簡単な方法があるのだろうか。

EDIT2:pygameには、0.025ミリ秒で必要なことだけを行うマスクオブジェクトがありますが、私のソリューションには35ミリ秒が必要で、インターネットで見つけたfind_contoursは4〜5ミリ秒で実行します。numpy 配列を使用するように pygame.mask.outline のソース コードを変更して、ここに投稿します。

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2 に答える 2

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これは、バイナリ numpy 配列のアウトラインを取得する非常に高速な方法です。

アウトライン.py:

from scipy.weave import inline, converters

_code = open("outline.c", "r").read()

def outline(data, every):
    width, height = data.shape
    return inline(_code, ['data', 'width', 'height', 'every'], type_converters=converters.blitz)

アウトライン.c:

/*
Modifioitu pygame.mask.Mask.outline
Input: data, width, height, every
*/

PyObject *plist, *value;
int x, y, e, firstx, firsty, secx, secy, currx, curry, nextx, nexty, n;
int a[14], b[14];
a[0] = a[1] = a[7] = a[8] = a[9] = b[1] = b[2] = b[3] = b[9] = b[10] = b[11]= 1;
a[2] = a[6] = a[10] = b[4] = b[0] = b[12] = b[8] = 0;
a[3] = a[4] = a[5] = a[11] = a[12] = a[13] = b[5] = b[6] = b[7] = b[13] = -1;

plist = NULL;
plist = PyList_New (0);
/*if (!plist) En ymmärrä mihin tätä tarvii
    return NULL;*/

every = 1;
n = firstx = firsty = secx = x = 0;

/*if(!PyArg_ParseTuple(args, "|i", &every)) {
    return NULL;
}

 by copying to a new, larger mask, we avoid having to check if we are at
   a border pixel every time.  
bitmask_draw(m, c, 1, 1); */

e = every;

/* find the first set pixel in the mask */
for (y = 1; y < height-1; y++) {
    for (x = 1; x < width-1; x++) {
        if (data(x, y)) {
             firstx = x;
             firsty = y;
             value = Py_BuildValue("(ii)", x-1, y-1);
             PyList_Append(plist, value);
             Py_DECREF(value);
             break;
        }
    }
    if (data(x, y))
        break;
}



/* covers the mask having zero pixels or only the final pixel
Pikseleitä on ainakin kymmenen
if ((x == width-1) && (y == height-1)) {
    return plist;
}        */

/* check just the first pixel for neighbors */
for (n = 0;n < 8;n++) {
    if (data(x+a[n], y+b[n])) {
        currx = secx = x+a[n];
        curry = secy = y+b[n];
        e--;
        if (!e) {
            e = every;
            value = Py_BuildValue("(ii)", secx-1, secy-1);
            PyList_Append(plist, value);
            Py_DECREF(value);
        }
        break;
    }
}       

/* if there are no neighbors, return
Pikseleitä on ainakin kymmenen
if (!secx) {
    return plist;
}*/

/* the outline tracing loop */
for (;;) {
    /* look around the pixel, it has to have a neighbor */
    for (n = (n + 6) & 7;;n++) {
        if (data(currx+a[n], curry+b[n])) {
            nextx = currx+a[n];
            nexty = curry+b[n];
            e--;
            if (!e) {
                e = every;
                if ((curry == firsty && currx == firstx) && (secx == nextx && secy == nexty)) {
                    break;
                }
                value = Py_BuildValue("(ii)", nextx-1, nexty-1);
                PyList_Append(plist, value);
                Py_DECREF(value);
            }
            break;
        }
    }
    /* if we are back at the first pixel, and the next one will be the
       second one we visited, we are done */
    if ((curry == firsty && currx == firstx) && (secx == nextx && secy == nexty)) {
        break;
    }

    curry = nexty;
    currx = nextx;
}

return_val = plist;
于 2013-01-08T20:03:42.770 に答える
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「2次元のnumpy配列をポリゴンに変換したい」-これを明確にしていただけますか? (元のグリッド上の) エッジ要素だけのラベル付き配列、またはポリゴン頂点座標の順序付きリストが必要ですか?

例:これを行います

[ [ 0, 0, 0, 0, 0 ], 
  [ 0, 1, 1, 1, 0 ], 
  [ 0, 1, 1, 1, 0 ], 
  [ 0, 1, 1, 1, 0 ], 
  [ 0, 0, 0, 0, 0 ] ]

これに変換されます:

[ [ 0, 0, 0, 0, 0 ], 
  [ 0, 1, 1, 1, 0 ], 
  [ 0, 1, 0, 1, 0 ], 
  [ 0, 1, 1, 1, 0 ], 
  [ 0, 0, 0, 0, 0 ] ]

または頂点のリストに( (1, 1), (3,1), (3,3), (1,3) )

それとも、最初にエッジを検索してから頂点を検索しますか?

あなたが望むのは単なるエッジであるという仮定に基づいて簡単に答えます(侵食などについて話しているため)。モルフォロジー操作(侵食など)を使用してエッジ検出を行おうとしているようです。エッジ検出も同様に直接行うことができます。ndimage.sobelまたはscikits.filter.canny、またはこれを使用します。

import numpy as np
import scipy.ndimage as ndimage
import matplotlib.pyplot as pyplot
im = np.zeros((32, 32))
im[8:-8, 8:-8] = 1
im = ndimage.rotate(im, 15)
im = numpy.where(im > 0.5, 1, 0)
edges = (ndimage.filters.maximum_filter(im, size=2) == ndimage.filters.minimum_filter(im, size=2))
pyplot.imshow(edges, interpolation='nearest')
pyplot.show()

データが既にしきい値処理されており (0 と 1)、エッジにノイズが多すぎない場合、エッジ検出器はうまく機能します。

于 2013-01-02T06:39:29.593 に答える