正規表現を使用したソリューションは次のとおりです。
x <- c('AAAAABBBBB', 'ABCAAABBBDDD')
gsub("([A-Za-z])\\1+","\\1",x)
編集:リクエストにより、いくつかのベンチマーク。任意の文字に一致する Matthew Lundberg のパターンをコメントに追加しました。gsub
桁違いに速いようで、任意の文字の一致は文字の一致よりも高速です。
library(microbenchmark)
set.seed(1)
##create sample dataset
x <- apply(
replicate(100,sample(c(LETTERS[1:3],""),10,replace=TRUE))
,2,paste0,collapse="")
##benchmark
xm <- microbenchmark(
SAPPLY = sapply(strsplit(x, ''), function(x) paste0(rle(x)$values, collapse=''))
,GSUB.LETTER = gsub("([A-Za-z])\\1+","\\1",x)
,GSUB.ANY = gsub("(.)\\1+","\\1",x)
)
##print results
print(xm)
# Unit: milliseconds
# expr min lq median uq max
# 1 GSUB.ANY 1.433873 1.509215 1.562193 1.664664 3.324195
# 2 GSUB.LETTER 1.940916 2.059521 2.108831 2.227435 3.118152
# 3 SAPPLY 64.786782 67.519976 68.929285 71.164052 77.261952
##boxplot of times
boxplot(xm)
##plot with ggplot2
library(ggplot2)
qplot(y=time, data=xm, colour=expr) + scale_y_log10()