"
Rに貼り付けたコマンド内に(二重引用符)を入れようとしています
paste("perl -ane 'system("cat /auto/Sample_output/tmp.$F[0].vcf >> Sample_90061.vcf");'",sep="")
それは言う
Error: unexpected symbol in "paste("perl -ane 'system("cat"
引用部分だけを作成して貼り付けてみました
complicated = paste('"cat /auto/Sample_output/tmp.$F[0].vcf >> Sample_90061.vcf"',sep="")
しかし、それは次のように表示されます
> complicated
[1] "\"cat /auto/Sample_output/tmp.$F[0].vcf >> Sample_90061.vcf\""
誰かがこの問題を解決するのを手伝ってもらえますか?