python - Python を使用して FASTA ファイルから quadruplex シーケンスを検索する

Question

ゲノムの四重配列は次のようになります。

Gx Ny1 Gx Ny2 Gx Ny3 Gx

ここで、G はグアニン塩基であり、N は他の塩基を表しています。x、y1、y2、y3 は整数です。

の場合、特定のセグメントは四重配列になりますx >= 2。

私の質問は、FASTA シーケンスに存在するそのようなセグメントの数と、x、y1、y2、および y3 に関するそれらのタイプを数えたいということです。そのためには、あなたの助けが必要です。