単一ページの開発 (ボディ スクロール トップ アニメーション) 最初にデモを確認し、'menu li a' http://jsfiddle.net/sUMaa/1/でアクティブ クラスの追加/削除を参照してください。
すべて問題ありませんが、単一の問題マウスでページをスクロールしている間、同じアクティブなクラス関数が必要です
jQuery('ul li a').click(function(){
var idName = jQuery(this).attr('href');
var idNameFixTop = jQuery(idName).offset().top;
jQuery('html, body').animate({scrollTop:idNameFixTop}, 1000);
jQuery('ul li a').removeClass('active');
jQuery(this).addClass('active');
});