使用するデータがファイルベースの場合は、UNIXでftpサーバーまたはsambaサーバーを使用できます。sambaサーバーの利点の1つは、ブロードキャスト機能があり、netbiosを介してネットワーク内のリソースを検出できることです。これは、ブロードキャスト要件に準拠します。
ファイルベースのストレージでは不十分な場合は、Webサービスを検討してください。.NETでアプリケーションを作成しているので、Unix側でMonoを使用するのが最も簡単です。WPFアプリケーションからの要求をリッスンするWebサービスをMonohttp ://www.mono-project.com/Writing_a_WebServiceで作成できます。
このソリューションは、パフォーマンス、スケーラビリティ、および移植性の点で最高ではないことを認めますが、.net開発者にとっては最速です。
アプリがUNIXマシンのリストを知る必要があることに関する他の要件は、より複雑です。ブルートフォースアプローチは、UNIXマシンが稼働したときに通知をリッスンするマスターサーバーを用意することです。そのリストがWPFクライアントに提供されます。
よりパフォーマンスの高いポータブルなソリューションを求めていて、より多くの開発リソースがある場合は、これらのフレームワークの1つでUNIX側にRESTフレームワークを使用してRESTfulサービスを実装できます。
開発時間の観点から最も複雑なアプローチは、ベアTCPIPを使用することです。それには、クライアント側とサーバー側の両方で多くのコーディングと、それを安定させるための長いプロセスが必要になります。繰り返しますが、それはデータの相互作用がどれほど複雑になるかによって異なります。
「同じネットワークにあるUnixマシンに保存されたデータを使用して」データベースにあると仮定すると、ある種のORM（NHibernateなど）をお勧めします。