python - RコードをPythonに埋め込む

Question

Pythonプログラムで計算を行う必要があり、そのうちのいくつかをRで作成したいと思います。RコードをPythonに埋め込むことは可能ですか？

Answer 1

rpyを確認する必要があります（ここにあるドキュメントへのリンク）。

これにより、次のことが可能になります。

from rpy import *

そしてr、Rで行うのと同じように、呼び出されたオブジェクトを使用して計算を行うことができます。

ドキュメントから抽出した例を次に示します。

>>> from rpy import *
>>>
>>> degrees = 4
>>> grid = r.seq(0, 10, length=100)
>>> values = [r.dchisq(x, degrees) for x in grid]
>>> r.par(ann=0)
>>> r.plot(grid, values, type=’lines’)

Answer 2

RPyはこの種のことのあなたの友達です。

scipy、numpy、matplotlibパッケージはすべて、Rと同様のことを行い、非常に完全ですが、言語を混合したい場合は、RPyが最適です。

from rpy2.robjects import *

def main(): 
    degrees = 4 
    grid = r.seq(0, 10, length=100) 
    values = [r.dchisq(x, degrees) for x in grid] 
    r.par(ann=0) 
    r.plot(grid, values, type='l') 

if __name__ == '__main__': 
     main()

Answer 3

R計算を行う必要がある場合、通常はRスクリプトを記述し、subprocessモジュールを使用してPythonから実行します。私がこれを選択した理由は、インストールされていたRIのバージョン（2.16だと思います）が当時のRPy（2.14が必要）と互換性がなかったためです。

したがって、すでにRを「希望どおりに」インストールしている場合は、これがより適切なオプションになる可能性があります。