私は現在、MRI スキャンから皮膚層をセグメント化し、画像をクリーンアップし、これをさらに処理するためにサーフェス ファイルに書き込む必要があるプロジェクトに取り組んでいます。しかし、私は 3D 医用画像処理の経験があまりなく (過去 1 年間、VTK の表面に手を出していました)、画像処理の経験はほとんどありません。タイトルが示すように、スキャンは Analyze 形式 (.hdr ヘッダーと .img データ) で提供されますが、実行しているセグメンテーション アルゴリズムには MetaImage (.mhd ヘッダーと .raw データ) 入力ファイルが必要です。現時点では、各スキャンを手動で Volview で開き、mhd ボリュームとして保存して変換しています。ご想像のとおり、これはますます面倒になってきているため、このプロセスを自動化する最善の方法を探しています。
私はWindows 7 64ビットを使用しており、VTK 5.10.0.RC1、MinGw、およびPython 2.7の動作バージョンがインストールされています（現在は使用していませんが、Matlab R2011a）。Google は、ITK と Matlab を使用した可能なソリューションを示しています。しかし、上記のソフトウェア パッケージをインストールして連携させるのは非常に面倒なので、現在の設定を変更するのは非常に気が進まないのです。私の計画では、今後数週間、不可解なコンパイル エラーのデバッグに時間を費やす余裕はありません。
私の質問は次のとおりです。Analyze から MetaImage ファイルへの変換を可能な限り迅速かつ簡単に (インストールに関して) 自動化するには、どのソフトウェアまたは方法を使用すればよいでしょうか?