3つの共変量を使用して多段マルコフ(MSM)モデルを適合させました。主な引数がMSMモデルと共変量の値に適合している関数を適用しようとしています。関数は次のとおりです。
transition<-qmatrix.msm(MSMmod, ci="normal", covariates=list(grossTon= 10, activ=0, period=1))
この関数の出力は推定値です。
Owning<10 Owning10-40 Owning>40 left
Owning<10 -0.18037446 0.06140559 0.00000000 0.118968868
Owning10-40 0.01609661 -0.09027454 0.04502546 0.029152476
Owning>40 0.00000000 0.04801757 -0.05137377 0.003356196
left 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.000000000
そして、私はそれらのいくつかだけに興味があるので、transition$estimates[c(5,2,10,7,13,14,15)]
私は得ています。たとえば、qmatrix.msm
共変量の組み合わせgrossTon = 120、active = 0、period = 1で関数が与える値(以下を参照)。
[1] 0.06140559 0.01609661 0.04502546 0.04801757 0.118968868 0.029152476 0.003356196
私の関数の両方のforループでは、grossTon(12個の値)とactiv(4個の値)のすべての組み合わせの結果として、48個のベクトル(前の値と同様に、それぞれ7個の値)を取得することを期待しています。それらの1つのベクトル(336の値、7 * 12 * 4)に。
これは私の機能です:
transRate<-function(period){
estim<-data.frame(matrix(rep(0,336),336,1))
for(i in seq(10,120,by=10)){
for(j in seq(0,3, by=1)){
estim[c(i,j)]<-qmatrix.msm(msm.Mult4, ci="normal", covariates=list(grossTon=i, activ=j, period=period))$estimates[c(5,2,10,7,13,14,15)]
outp[c(i,j)]<-c(estim[c(i,j)])#Here I'm trying to get my 336 values vector
}
}
grosTvect<-sort(rep(seq(10,120,by=10),28))
rate<-rep(c("q12","q21","q23","q32","q14","q24","q34"),48)
estimRate<-data.frame(grosTvect,rate,outp)
return(estimRate)
}
dataFrame<-transRate(period=1)
ベクトルを生成するためにiとjを処理する方法がわかりません。
と書くestim[c(i,j)]
と次のエラーが発生しますoutp[c(i,j)]<-c(estim[c(i,j)])
error in `[<-.data.frame`(`*tmp*`, c(i, j), value = c(0.0614055886960195, :
new columns would leave holes after existing columns
そして、これは私が書いたときestim[i,j]
とoutp<-estim[i,j
]
Error in `[<-.data.frame`(`*tmp*`, i, j, value = c(0.0614055886960195, :
replacement has 7 rows, data has 1
どんな助けでもありがたいです。