そこで、フォルダー内のすべての csv ファイルから平均を計算するための小さなテスト コードを作成しました。
parser = argparse.ArgumentParser(description='avg data from csv to csv')
parser.add_argument('--input', required = True)
parser.add_argument('--output', required = True)
args = parser.parse_args()
# Get command arguments
input_files_path = args.input
output = args.output
avg = []
for infile in glob.glob(input_files_path+"*.csv"):
a = np.loadtxt(infile, delimiter=",")
mean = np.mean(a, axis=0)
avg.append((mean))
print infile
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
しかし、今の問題は、ファイルの名前も次のようにcsvファイルに保存しようとしているときです:
parser = argparse.ArgumentParser(description='avg data from csv to csv')
parser.add_argument('--input', required = True)
parser.add_argument('--output', required = True)
args = parser.parse_args()
# Get command arguments
input_files_path = args.input
output = args.output
avg = []
for infile in glob.glob(input_files_path+"*.csv"):
a = np.loadtxt(infile, delimiter=",")
mean = np.mean(a, axis=0)
avg.append((infile,(mean)))
print infile
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
エラーがスローされます:
np.savetxt(output,(avg), fmt = "%.1f", delimiter=", ")
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.py", line 963, in savetxt
X = np.asarray(X)
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/numeric.py", line 235, in asarray
return array(a, dtype, copy=False, order=order)
ValueError: cannot set an array element with a sequence
私は問題が何であるかを理解していないようです。たぶん、フロートに文字列を追加しようとしているからでしょうか? numpy.. で sを確認しfmt
ましたが、興味深いものは見つかりませんでした。
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.py:773: UserWarning: loadtxt: Empty input file: "../robalo-31.1/op.csv"
warnings.warn('loadtxt: Empty input file: "%s"' % fname)
/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/fromnumeric.py:2374: RuntimeWarning: invalid value encountered in double_scalars
return mean(axis, dtype, out)