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2つのサブグループを持つ母集団にサバイバルパッケージを使用しています。各グループの5年のKM生存率が必要です。私はこの値を以下から取得しました：

summary(survfit(Surv(survtime, vital)~subgroup)), time = 60) #in months

ただし、5年生存率2つについてカイ2乗検定も実行したいと思いました。サバイバルパッケージを使用してこのテストを実行する簡単な方法はありますか？

アドバイスと助けてくれてありがとう！

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これが正しい方法であるかどうかはわかりませんが（購入者は注意してください）、パッケージamlにサンプルデータとして含まれているデータセットを使用した例を次に示します。survival

library(survival)
amlsurv <- with(aml,survfit(Surv(time,status) ~ x))
summary(amlsurv ,time=20)

その結果、次のようになりtime=20ます。

Call: survfit(formula = Surv(time, status) ~ x)

                x=Maintained 
        time       n.risk      n.event
      20.000        7.000        3.000 ...

                x=Nonmaintained 
        time       n.risk      n.event
      20.000        6.000        5.000 ...

これらのオプションは両方とも、次のsurvdiff関数を使用して失敗します。

survdiff(summary(aml,time=20))
survdiff(aml,time=20)

次に、手動で20日に制限してみてください。

aml$status.20 <- aml$status
# set 'deaths' with a time greater than 20 to be 'survivors'
aml$status.20[aml$status == 1 & aml$time > 20] <- 0
amlsurv <- (Surv(aml$time,aml$status.20) ~ aml$x)
summary(survfit(amlsurv))
# results are the same as above, Maintained=3 events,Nonmaintained=5 events

これで、2つのグループを比較して20日間の制限の結果を得ることができます。

survdiff(amlsurv)
Call:
survdiff(formula = amlsurv)

                     N Observed Expected (O-E)^2/E (O-E)^2/V
aml$x=Maintained    11        3      4.3     0.392     0.874
aml$x=Nonmaintained 12        5      3.7     0.455     0.874

 Chisq= 0.9  on 1 degrees of freedom, p= 0.35
于 2013-02-04T06:08:54.823 に答える
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あなたは簡単に使うことができますsurvdiff()：

s.fit <- survfit(Surv(survtime, vital)~subgroup)
survdiff(s.fit)
于 2013-04-30T09:42:35.733 に答える