各行に長い文字列があり、次のような1行です。
1000 AS34_59329 RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93 /ifshk5/BC_IP/PROJECT/T11073/T11073_RICekkR/Fq/AS34_59329/111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93_1.fq.gz /ifshk5/BC_IP/PROJECT/T11073/T11073_RICekkR/Fq/AS34_59329/ 111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93_2.fq.gz /ifshk5/BC_IP/PROJECT/T11073/T11073_RICekkR/Fq/AS34_59329/clean_111220_I631_FCC0E5EACXX_L4_RICwdsRSYHSD11-2-IPAAPEK-93_1.fq.gz.total.info 11.824 0.981393 43.8283 95.7401 OK
この行には 3 つのファイルの場所 (太字部分) が含まれています。これらのファイルを /sample などの別の場所に scp する必要があります。AS34_59329 に配置されたこの行のファイルのように、ファイルを配置するためのサブディレクトリも作成します。/sample/AS34_59329 を作成する必要があります。サブディレクトリ名が同じ行が何行もある可能性があるため、サブディレクトリが既に作成されているかどうかを判断する必要があります。サブディレクトリを自動作成する方法は?
#! /bin/bash
while read myline
do
for i in $myline
do
if [ -f $i]; then
scp -r $i xxxx@192.168.174.33:/sample
fi
done
done < data.list