重回帰で部分 R^2 を計算するための R パッケージを知っている人はいますか? パッケージ asbio からコマンド partial.R2 を試しましたが、提供されたドキュメントの例でもエラー メッセージが表示されます。
どうもありがとう。
パッケージ lmSupport のコマンド lm.sumSquares が部分的および半部分的な相関によって提供されることがわかりました。
John Neter、Michael H Kutner、William Wasserman、Christopher J. Nachtsheim による「Applied Linear Statistical Models」のデータ
274 ページのセクション 7.4:
# body fat example from Neter et al. via rhelp archives:
bf.dat <- read.table(text="x1 x2 x3 y
1 19.5 43.1 29.1 11.9
2 24.7 49.8 28.2 22.8
3 30.7 51.9 37.0 18.7
4 29.8 54.3 31.1 20.1
5 19.1 42.2 30.9 12.9
6 25.6 53.9 23.7 21.7
7 31.4 58.5 27.6 27.1
8 27.9 52.1 30.6 25.4
9 22.1 49.9 23.2 21.3
10 25.5 53.5 24.8 19.3
11 31.1 56.6 30.0 25.4
12 30.4 56.7 28.3 27.2
13 18.7 46.5 23.0 11.7
14 19.7 44.2 28.6 17.8
15 14.6 42.7 21.3 12.8
16 29.5 54.4 30.1 23.9
17 27.7 55.3 25.7 22.6
18 30.2 58.6 24.6 25.4
19 22.7 48.2 27.1 14.8
20 25.2 51.0 27.5 21.1 ", header=TRUE)
library(rms) # will also load Hmisc
fit <- ols(y ~ x1 + x2, data=bf.dat)
plt <- plot(anova(fit), what='partial R2')
plt
# x2 x1
#0.066955220 0.007010427