現在、コンピューティングクラスターでRコードを実行しようとしていますinstall.packages
が、クラスターのファイアウォール設定がおかしいため、関数を実行できません。install.packages
Rコードで使用しているパッケージはごくわずかなので、パッケージを手動でダウンロードしてインストールすることで、この関数の使用を避けたいと考えていました。
注:R FAQで説明されているように、HTTPプロキシを使用してこの問題を回避する方法があることを認識しています。残念ながら、私のクラスターの担当者はこれを設定するのに役立っていないので、私はこの代替アプローチを検討することを余儀なくされています。
理想的には、パッケージファイルをCRANからコンピューターにダウンロードしてから、これらのファイルをクラスターにアップロードし、Rの適切なコマンドを使用してインストールします。さらに、パッケージがデフォルトのRディレクトリに「書き込む」権限がないため、選択した場所(関数を使用してR内でこれを実行できると思い.libPaths
ます)
最後に、クラスターで使用しているコンピューターはUnixx86_64です。