93

downloadButton を使用して、光沢のあるプロットを保存する方法を理解しようとしています。パッケージの例はdownloadButton/downloadHandler、.csv を保存する方法を示しています。それに基づいて再現可能な例を作成します。

為にui.R

shinyUI(pageWithSidebar(
  headerPanel('Downloading Data'),
  sidebarPanel(
selectInput("dataset", "Choose a dataset:", 
            choices = c("rock", "pressure", "cars")),
    downloadButton('downloadData', 'Download Data'),
    downloadButton('downloadPlot', 'Download Plot')
  ),
  mainPanel(
    plotOutput('plot')
  )
))

為にserver.R

library(ggplot2)
shinyServer(function(input, output) {
  datasetInput <- reactive({
    switch(input$dataset,
           "rock" = rock,
           "pressure" = pressure,
           "cars" = cars)
  })
  
  plotInput <- reactive({
    df <- datasetInput()
    p <-ggplot(df, aes_string(x=names(df)[1], y=names(df)[2])) +
      geom_point()
  })
  
  output$plot <- renderPlot({
    print(plotInput())
  })
  
  output$downloadData <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.csv', sep='') },
    content = function(file) {
      write.csv(datatasetInput(), file)
    }
  )
  output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      ggsave(file,plotInput())
    }
  )
})

この質問に回答している場合は、おそらくこれに精通しているでしょうが、これを機能させるには、上記を別のスクリプト (ui.Rおよび作業ディレクトリ内のserver.Rフォルダー ( foo) ) に保存します。光沢のあるアプリを実行するには、 を実行しますrunApp("foo")

を使用すると、関数を使用できないことggsaveを示すエラー メッセージが表示されます (と思います)。標準のグラフィック デバイス (以下のようなもの) を使用すると、エラーは発生しませんが、グラフィックは書き込まれません。ggsavefilenameDownload Plot

プロットを作成するために downloadHandler を機能させるためのヒントをいただければ幸いです。

4

4 に答える 4

77

この質問がまだアクティブかどうかはわかりませんが、「光沢のあるアプリでプロットを保存する」を検索したときに最初に出てきた質問なので、元の質問の行に沿って ggsave を downloadHandler と連携させる方法をすばやく追加したいと思いました。

ggsave の代わりに直接出力を使用して juba によって提案された代替戦略と、alexwhan 自身によって提案された代替戦略はどちらもうまく機能します。

alexwhan によって報告された問題は、ggsave がファイル拡張子を正しいグラフィックス デバイスに一致させようとするために発生します。ただし、一時ファイルには拡張子がないため、照合は失敗します。ggsaveこれは、元のコード例 (png の場合) のように、関数呼び出しでデバイスを具体的に設定することで解決できます。

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) grDevices::png(..., width = width, height = height, res = 300, units = "in")
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
    }
)

この呼び出しは基本的に、内部で割り当てるdevicea の関数を受け取ります (関数コードを見て、、 などの構文を確認できます)。おそらく、理想的には、ファイル拡張子 (ファイル名と異なる場合 - ここでは一時ファイルの場合のように) をパラメータとして指定できますが、このオプションは現在.pngggsaveggsavejpgpdfggsaveggsave


最小限の自己完結型の作業例:

library(shiny)
library(ggplot2)
runApp(list(
  ui = fluidPage(downloadButton('foo')),
  server = function(input, output) {
    plotInput = function() {
      qplot(speed, dist, data = cars)
    }
    output$foo = downloadHandler(
      filename = 'test.png',
      content = function(file) {
        device <- function(..., width, height) {
          grDevices::png(..., width = width, height = height,
                         res = 300, units = "in")
        }
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = device)
      })
  }
))

sessionInfo()
# R version 3.1.1 (2014-07-10)
# Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)
# 
# locale:
#  [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#  [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
#  [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
#  [7] LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
#  [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
# [11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
# 
# attached base packages:
# [1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     
# 
# other attached packages:
# [1] ggplot2_1.0.0 shiny_0.10.1 
# 
# loaded via a namespace (and not attached):
#  [1] bitops_1.0-6     caTools_1.17     colorspace_1.2-4 digest_0.6.4    
#  [5] formatR_1.0      grid_3.1.1       gtable_0.1.2     htmltools_0.2.6 
#  [9] httpuv_1.3.0     labeling_0.2     MASS_7.3-34      munsell_0.4.2   
# [13] plyr_1.8.1       proto_0.3-10     Rcpp_0.11.2      reshape2_1.4    
# [17] RJSONIO_1.3-0    scales_0.2.4     stringr_0.6.2    tools_3.1.1     
# [21] xtable_1.7-3    

アップデート

ggplot2 バージョン 2.0.0 の時点で、このggsave関数はパラメーターの文字入力をサポートしていdeviceます。つまり、downloadHandler によって作成された一時ファイルは、ggsave使用する拡張子が"pdf"(渡すのではなく)デバイス関数で)。これにより、上記の例が次のように簡略化されます

output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
        ggsave(file, plot = plotInput(), device = "png")
    }
)
于 2014-04-06T22:54:29.483 に答える
25

で動作させることはできませんでしggsaveたが、標準の呼び出しpng()では問題ないようです。

私はあなたのファイルのoutput$downloadPlot一部だけを変更しました:server.R

 output$downloadPlot <- downloadHandler(
    filename = function() { paste(input$dataset, '.png', sep='') },
    content = function(file) {
      png(file)
      print(plotInput())
      dev.off()
    })

0.3 バージョンの Shiny にはいくつか問題がありましたが、Github の最新バージョンで動作することに注意してください。

library(devtools)
install_github("shiny","rstudio")
于 2013-02-11T13:15:38.887 に答える
24

光沢のあるプロットを保存するために ggsave を使用できるようにするソリューションを次に示します。論理的なチェックボックスとテキスト入力を使用して を呼び出しますggsave()ui.Rこれを次のファイルに追加しsidebarPanelます。

textInput('filename', "Filename"),
checkboxInput('savePlot', "Check to save")

次に、現在のreactPlot 関数server.Rの代わりにこれをファイルに追加します。output$plot

output$plot <- reactivePlot(function() {
    name <- paste0(input$filename, ".png")
    if(input$savePlot) {
      ggsave(name, plotInput(), type="cairo-png")
    }
    else print(plotInput())
  })

次に、ユーザーはテキストボックスに目的のファイル名を (拡張子なしで) 入力し、チェックボックスをオンにして app ディレクトリに保存します。ボックスのチェックを外すと、プロットが再度印刷されます。これを行うためのより適切な方法があると確信していますが、少なくとも Windows で ggsave と cairo を使用して、より優れた png グラフィックを表示できるようになりました。

提案があれば追加してください。

于 2013-02-12T22:58:41.840 に答える
22

これは古いものですが、誰かが「R Shiny save ggplot」をグーグルで検索したときのトップヒットなので、別の回避策を提供します。非常に簡単です...グラフを表示するのと同じ関数で ggsave を呼び出します。これにより、グラフがファイルとしてサーバーに保存されます。

output$plot <- renderPlot({
    ggsave("plot.pdf", plotInput())
    plotInput()
})

次に、downloadHandler を使用file.copy()して、既存のファイルから「file」パラメーターにデータを書き込みます。

output$dndPlot <- downloadHandler(
    filename = function() {
        "plot.pdf"
    },
    content = function(file) {
        file.copy("plot.pdf", file, overwrite=TRUE)
    }
)

私のために働きます。

于 2014-07-30T05:08:14.457 に答える