-1

PDBデータベースからのpdb形式のタンパク質構造の特定のセットについて、各構造がモノマー、ダイマー、トリマーなどであるかどうかを確認するための自動化された方法を見つけたいので、それぞれの場合についてユニット構造またはモノマーのみを取得します。私はbiopythonについて話しますが、これについて他のアプローチがあるかどうかはわかりません。

4

1 に答える 1

1

最初のステップは、PDBデータベースにアクセスすることのようです。私はbiopythonに精通していませんが、ドキュメントからは、次のデータベースコネクタのみが組み込まれているように見えます。

  • ExPASy
  • SCOP
  • NCBIのEntrez（およびPubmed）

PDBデータベースにどのように接続するか知っていますか？

于 2013-02-11T17:32:15.440 に答える