行列のすべての行の外積を計算する効率的な方法を見つけるのに助けが必要です。
これまで私は試しました
X <- matrix(1:100, ncol=4)
lapply(1:i, function(i) tcrossprod(X[i,]))
「現実の」(別名「大きな」)マトリックスに適用すると、かなり遅くて面倒なので、ゾッとします。
結果の型が配列かリストかは問題ではありません。
何か案は?plyr
友達も遅くなります。
行列のすべての行の外積を計算する効率的な方法を見つけるのに助けが必要です。
これまで私は試しました
X <- matrix(1:100, ncol=4)
lapply(1:i, function(i) tcrossprod(X[i,]))
「現実の」(別名「大きな」)マトリックスに適用すると、かなり遅くて面倒なので、ゾッとします。
結果の型が配列かリストかは問題ではありません。
何か案は?plyr
友達も遅くなります。
以下のコードで目的の出力が得られますか? もしそうなら、それはあなたのデータで十分に速いですか?
library(data.table)
# Example matrix
m <- matrix(1:100, ncol=4)
# Convert to data.table
X <- as.data.table(m)
# Add row numbers
X[,row:=1:nrow(X)]
# Reshape to long format
X.long<-data.table(reshape(X, direction="long", varying=list(rev(rev(names(X))[-1])), v.names="value", idvar="row", timevar="col", times=1:(ncol(X)-1)),key="row")
# Join the long data.table to itself, perform the products, and then reshape back to wide format
reshape(X.long[X.long,list(col=i.col, col.old=col, prod=value*i.value)], direction="wide", idvar=c("row","col"), timevar="col.old")
## row col prod.1 prod.2 prod.3 prod.4
## 1: 1 1 1 26 51 76
## 2: 1 2 26 676 1326 1976
## 3: 1 3 51 1326 2601 3876
## 4: 1 4 76 1976 3876 5776
## 5: 2 1 4 54 104 154
## 6: 2 2 54 729 1404 2079
## 7: 2 3 104 1404 2704 4004
## 8: 2 4 154 2079 4004 5929
## ... etc