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私はsdfファイル（多くの分子を含む）を読み込んで、分子の加重隣接行列を返したいと思っています。原子は頂点として、結合はエッジとして扱う必要があります。i頂点とj頂点が単結合、二重結合、または三重結合で接続されている場合、隣接行列の対応するエントリはそれぞれ 1、2、および 3 になります。異なる距離にある頂点の数をリストする各頂点の距離ベクトルをさらに取得する必要があります。

これを行うために利用できるpythonパッケージはありますか？

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見る

http://code.google.com/p/cinfony/

ただし、正確な問題については、ドキュメントを参照する必要があります。

于 2013-03-22T20:40:44.783 に答える