アラートが表示されない理由がわかりません。コンソールにエラーはなく、PhoneGap.jsファイルが見つかっていると確信しています。
<!doctype html>
<html>
<body>
<script src="//ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1/jquery.js"></script>
<script src="/Matrix/PhoneGap/Inc/js/PhoneGap.js"></script>
<script>
function myDeviceReady() {
alert('Ready!');
}
document.addEventListener("deviceready", myDeviceReady, false);
</script>
</body>
</html>
編集:これは、SafariまたはGoogleChromeを使用しているiPhoneでは機能しません。