R の一連のコマンドを.txt
、ディレクトリ内のすべての個々のファイル (約 300) に適用する必要があります。
私は R にあまり詳しくないので、オンラインで調べたループに関するすべてのヘルプが混乱を招くか、各ファイルに複数のコマンドを適用する必要がある場合にループを適用する方法がわかりません。
ディレクトリ内の各ファイル (系統樹) に適用する必要があるコマンドは次のとおりです (R の ape ライブラリを使用します)。
testtree <- read.tree("tree123.txt")
unrooted_tr <- unroot(testtree)
write.tree(unrooted_tr, file="unrootedtree123.txt")
これらのコマンドを個々の .txt ファイルに適用するループを適用するにはどうすればよいですか (R を使用するか、Unix コマンド ラインで)。出力 (例: unrootedtree123.txt) には、個々のファイルごとに異なる名前を付ける必要があります。
前もってありがとう、ダニ。