バイオインフォマティクスの CGH 分析のために Python でモジュールを探しています。いくつかのツールを見つけましたが、それらは Web ベースであり、すべてのグラフで CGH 分析を扱う Python のモジュールは見つかりませんでした。
Python でコマンド ライン モジュールが必要です。
同じことを知っている人がいたら教えてください。
ありがとう
バイオインフォマティクスの CGH 分析のために Python でモジュールを探しています。いくつかのツールを見つけましたが、それらは Web ベースであり、すべてのグラフで CGH 分析を扱う Python のモジュールは見つかりませんでした。
Python でコマンド ライン モジュールが必要です。
同じことを知っている人がいたら教えてください。
ありがとう
見つけられるとは思えません。配列作業を行っていて、コマンド ライン経由で実行したい場合は、R について学び、CGH 分析用の多くのパッケージの 1 つを選択してください。あなたを助けるためにそこにいくつかのpython / Rバインディングがあると確信しています。
http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html
http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html