そのため、テキストファイルをリストに変換し、リスト内の各アイテムをスペースで分割して、テキストファイルを解析しようとしています。
コードのこの部分を単独で実行するためのテスト変数を作成しました。スパイダーエディターの私のコード:
test = ['NC_009142.1_03_012_002_001 560', 'NC_017586.1_13_009_003_001 555', 'NC_016111.1_13_010_003_001 555']
ListOfLinesParsed = test
PN_List = []
counter_iterative = 0
while counter_iterative < len(ListOfLinesParsed):
PN_List = PN_List.append(ListOfLinesParsed[counter_iterative].split()[0])
counter_iterative += 1
print PN_List
これはエラーを返します:
runfile(r'/home/jake/.spyder2/.temp.py'、wdir = r'/home/jake/.spyder2')
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-
packages/spyderlib/widgets/externalshell/sitecustomize.py", line 493, in runfile
execfile(filename, namespace)
File "/home/jake/.spyder2/.temp.py", line 7, in <module>
PN_List = PN_List.append(ListOfLinesParsed[counter_iterative].split()[0])
AttributeError: 'NoneType' object has no attribute 'append'
しかし、コマンドをターミナルに直接入力しても、エラーは発生しません。
testL = []
testL.append(test [0] .split()[0])
testL
['NC_009142.1_03_012_002_001']
testL.append(test [1] .split()[0])
testL
['NC_009142.1_03_012_002_001', 'NC_017586.1_13_009_003_001']
testL.append(test [2] .split()[0])
testL
['NC_009142.1_03_012_002_001', 'NC_017586.1_13_009_003_001', 'NC_016111.1_13_010_003_001']
2つのことはまったく同じであるべきではありませんか?スクリプト内のものがターミナルコマンドとは異なる動作をしている理由がわかりません。