r - R のプロットに標準偏差を表示するエラー バーを追加します。

Question

各値について、各 Y値Xの平均Y値と標準偏差 ( ) を計算しましたsd

x  = 1:5
y  = c(1.1, 1.5, 2.9, 3.8, 5.2)
sd = c(0.1, 0.3, 0.2, 0.2, 0.4)

plot (x, y)

標準偏差を使用して、プロットの各データポイントにエラー バーを追加するにはどうすればよいですか?

Answer 1

ソリューションggplot2:

qplot(x,y)+geom_errorbar(aes(x=x, ymin=y-sd, ymax=y+sd), width=0.25)

Answer 2

@ csgillespieの答えに加えてsegments、この種のことを助けるためにベクトル化されています:

plot (x, y, ylim=c(0,6))
segments(x,y-sd,x,y+sd)
epsilon <- 0.02
segments(x-epsilon,y-sd,x+epsilon,y-sd)
segments(x-epsilon,y+sd,x+epsilon,y+sd)

Answer 3

を使用segmentsして、ベース グラフィックにバーを追加できます。ここでepsilonは、ラインの上下を横切るラインを制御します。

plot (x, y, ylim=c(0, 6))
epsilon = 0.02
for(i in 1:5) {
    up = y[i] + sd[i]
    low = y[i] - sd[i]
    segments(x[i],low , x[i], up)
    segments(x[i]-epsilon, up , x[i]+epsilon, up)
    segments(x[i]-epsilon, low , x[i]+epsilon, low)
}

@thelatemail が指摘するように、ベクトル化された関数呼び出しを実際に使用する必要がありました。

segments(x, y-sd,x, y+sd)
epsilon = 0.02
segments(x-epsilon,y-sd,x+epsilon,y-sd)
segments(x-epsilon,y+sd,x+epsilon,y+sd)

Answer 4

対数 X 軸がある場合、csgillespie ソリューションの問題が表示されます。右側と左側の小さなバーの長さが異なります (イプシロンは x 値に従います)。

パッケージのerrbar関数をより適切に使用する必要があります。Hmisc

d = data.frame(
  x  = c(1:5)
  , y  = c(1.1, 1.5, 2.9, 3.8, 5.2)
  , sd = c(0.2, 0.3, 0.2, 0.0, 0.4)
)

##install.packages("Hmisc", dependencies=T)
library("Hmisc")

# add error bars (without adjusting yrange)
plot(d$x, d$y, type="n")
with (
  data = d
  , expr = errbar(x, y, y+sd, y-sd, add=T, pch=1, cap=.1)
)

# new plot (adjusts Yrange automatically)
with (
  data = d
  , expr = errbar(x, y, y+sd, y-sd, add=F, pch=1, cap=.015, log="x")
)