入力ファイル1:
5 5 NA
NA NA 1
2 NA 2
入力ファイル2:
1 1 1
2 NA 2
3 NA NA
NA 4 4
5 5 5
NA NA 6
出力:
3 NA NA
NA 4 4
NA NA 6
目的は次のとおりです。file1で、セットに含まれていない各行の項目をNA
設定し、次にfile2で、フィールドがこのセット内にある行を削除します。誰かがこれについてアイデアを持っていますか?
'NA'以外のアイテムを追加するには:
awk -f script.awk file1 file2
内容script.awk
:
FNR==NR {
for (i=1;i<=NF;i++) {
if ($i != "NA") {
a[$i]++
}
}
next
}
{
for (j=1;j<=NF;j++) {
if ($j in a) {
next
}
}
}1
結果:
3 NA NA
NA 4 4
NA NA 6
または、これがワンライナーです。
awk 'FNR==NR { for (i=1;i<=NF;i++) if ($i != "NA") a[$i]++; next } { for (j=1;j<=NF;j++) if ($j in a) next }1' file1 file2
あなたはこれを行うことができますgrep
:
$ egrep -o '[0-9]+' file1 | fgrep -wvf - file2
3 NA NA
NA 4 4
NA NA 6
awkワンライナー:
awk 'NR==FNR{for(i=1;i<=NF;i++)if($i!="NA"){a[$i];break} next}{for(i=1;i<=NF;i++)if($i in a)next;}1' file1 file2
あなたのデータで:
kent$ awk 'NR==FNR{for(i=1;i<=NF;i++)if($i!="NA"){a[$i];break;} next}{for(i=1;i<=NF;i++)if($i in a)next;}1' file1 file2
3 NA NA
NA 4 4
NA NA 6
値の列の位置が重要な場合:
awk '
NR==FNR{
for(i=1; i<=NF; i++) if($i!="NA") A[i,$i]=1
next
}
{
for(i=1; i<=NF; i++) if($i!=NA && A[i,$i]) next
print
}
' file1 file2