以下のご協力をよろしくお願いいたします。
デュアルブートラップトップ（-Ubuntu 12.04 LTS、64ビットおよびMS Windows 7 64ビット）でPythonコード（Ipython、Pythonバージョン2.7.3を使用）を実行しようとしています。Windowsでコードを実行すると正常に動作しますが、何らかの理由でUbuntuでメモリエラーが発生します。これがPythonの問題なのかOSの問題なのかわかりません。私はMSウィンドウでコードを実行することに固執しますが、Ubuntuでコードを実行するときに持っていないライブラリのインポートなど、私が苦労している独自の問題があります。
コードはかなり単純です。参考までに、ラボの3つのチャネルからの16ビットの符号付き数値を表す大きなバイナリファイルがあります。楽器。データは10MS/秒でサンプリングされました。ファイルは約1.GGバイトで、約25秒のデータを表します。以下のコードでは、データを「data」に読み込み、Matplotlibのスペクトログラム関数を使用してスペクトログラムをプロットしたいと思います。この部分はWindowsでは正常に機能しますが、Ubuntuでは機能しません。
いくつかのコード...
import os
import sys
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import matplotlib.mlab as mlab
file = "data_stream.srm"
with open(file,'rb') as fd:
fd.seek(0)
data = np.fromfile(fd,dtype=[('ch0','<i2'),('ch1','<i2'),('ch2','<i2')])
データの内容（生の信号値）は次のようになります。
array([(-1, 5, -3), (-4, 3, -4), (-6, 0, -3), ..., (-1, -2, 0),
(-2, -1, -2), (-2, -2, -1)],
dtype=[('ch0', '<i2'), ('ch1', '<i2'), ('ch2', '<i2')])
おそらくそれを行うための最良の方法ではありませんが、ここまでは正常に機能します（UbuntuとWindowsの両方で）。データのサイズ（data.shapeを使用）は（261144000、）を与えます。この大きな数は、3つのチャネルごとの行数（したがって値の数）であるため、形状が（261144000,3）であることがわかると予想されます。たとえば、次のように入力します。
len(data'ch0'])
戻る、261144000
次の問題は、matplotlibのスペクトログラム関数を使用したスペクトログラムです。
specgram(x, NFFT=256, Fs=2, Fc=0, detrend=mlab.detrend_none,
window=mlab.window_hanning, noverlap=128,
cmap=None, xextent=None, pad_to=None, sides='default',
scale_by_freq=None, **kwargs)
いくつかのコード..。
ADCR = 12 # ADC Resolution in bits
VOLT = 5.0 # Voltage range
SF = VOLT/(2**ADCR) # scaling factor to convert raw ADC values to volts
w_length= 512
nFFT=2 * w_length
n_overlap=np.fix(w_length/2)
p_to = 4 *w_length
cmap=plt.cm.seismic
Fs = 10E6 # Sampling Frequency
fig=plt.figure()
ax=fig.add_subplot(111)
Pxx, freqs, bins,im =
plt.specgram((data['ch1'])*SF,NFFT=nFFT,Fs=Fs,noverlap=n_overlap,pad_to=p_to,cmap=cmap)
この最後のコマンドの実行はWindowsでは機能しますが、Ubuntuでは機能しません。次のメッセージが表示されます。
メモリエラー...「投稿するには10のレピュテーションが必要なため、画像を投稿できません」
MemoryError Traceback (most recent call last)
/media/IomegaHDD/<ipython-input-28-5144fe0c6918> in <module>()
----> 1 Pxx, freqs, bins, im = plt.specgram((data['ch1'])*SF,NFFT=nFFT,Fs=Fs,detrend=mlab.detrend_linear,noverlap=n_overlap,pad_to=p_to,scale_by_freq=True,cmap=cmap)
/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/pyplot.pyc in specgram(x, NFFT, Fs, Fc, detrend, window, noverlap, cmap, xextent, pad_to, sides, scale_by_freq, hold, **kwargs)
2609 ax.hold(hold)
2610 try:
-> 2611 ret = ax.specgram(x, NFFT, Fs, Fc, detrend, window, noverlap, cmap, xextent, pad_to, sides, scale_by_freq, **kwargs)
2612 draw_if_interactive()
2613 finally:
/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/axes.pyc in specgram(self, x, NFFT, Fs, Fc, detrend, window, noverlap, cmap, xextent, pad_to, sides, scale_by_freq, **kwargs)
8146
8147 Pxx, freqs, bins = mlab.specgram(x, NFFT, Fs, detrend,
-> 8148 window, noverlap, pad_to, sides, scale_by_freq)
8149
8150 Z = 10. * np.log10(Pxx)
/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/mlab.pyc in specgram(x, NFFT, Fs, detrend, window, noverlap, pad_to, sides, scale_by_freq)
458
459 Pxx, freqs, t = _spectral_helper(x, x, NFFT, Fs, detrend, window,
--> 460 noverlap, pad_to, sides, scale_by_freq)
461 Pxx = Pxx.real #Needed since helper implements generically
462
/usr/lib/pymodules/python2.7/matplotlib/mlab.pyc in _spectral_helper(x, y, NFFT, Fs, detrend, window, noverlap, pad_to, sides, scale_by_freq)
256 ind = np.arange(0, len(x) - NFFT + 1, step)
257 n = len(ind)
--> 258 Pxy = np.zeros((numFreqs, n), np.complex_)
259
260 # do the ffts of the slices
MemoryError:
私が言ったように、おそらくそれは私が知らないUbuntuの問題であり、Windowsでコードを実行するとこの問題は発生しません。ただし、これには、コードの他の後続部分に関する独自の問題があります。
よろしくお願いします。
ありがとうございました。
よろしく、
意思。