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大きなシーケンスに対しては、needleman-wunsch アルゴリズムや smith-watterman アルゴリズムのようなアルゴリズムを実行します。したがって、さまざまなサイズの行列を作成する方法が必要になるので、質問は、どのライブラリがその上で最高のパフォーマンスを発揮し、使いやすいかということです。

PS: OpenCV と Boost が行列を処理できることは知っていますが、それに対して適切な操作があるかどうかはわかりません。

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「最高のパフォーマンス」が必要な場合は、NVIDIA CUDA または Intel MKL を検討する必要があります。C++ のようなライブラリは、uBLAS をパフォーマンスではなく使いやすさに集中させます。

于 2013-03-04T21:19:27.390 に答える