本当に両方のデータフレームに存在するインデックスによって各データフレームをサブセット化したい場合は、次のように「match」関数を使用してこれを行うことができます。
data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]
ただし、これは次と同じです。
data_A[data_A$index %in% data_B$index,]
data_B[data_B$index %in% data_A$index,]
これがデモです:
# Set seed for reproducibility.
set.seed(1)
# Create two sample data sets.
data_A <- data.frame(index=sample(1:200, 90, rep=FALSE), value=runif(90))
data_B <- data.frame(index=sample(1:200, 120, rep=FALSE), value=runif(120))
# Subset data of each data frame by the index in the other.
t_A <- data_A[match(data_B$index, data_A$index, nomatch=0),]
t_B <- data_B[match(data_A$index, data_B$index, nomatch=0),]
# Make sure they match.
data.frame(t_A[order(t_A$index),], t_B[order(t_B$index),])[1:20,]
# index value index.1 value.1
# 27 3 0.7155661 3 0.65887761
# 10 12 0.6049333 12 0.14362694
# 88 14 0.7410786 14 0.42021589
# 56 15 0.4525708 15 0.78101754
# 38 18 0.2075451 18 0.70277874
# 24 23 0.4314737 23 0.78218212
# 34 32 0.1734423 32 0.85508236
# 22 38 0.7317925 38 0.56426384
# 84 39 0.3913593 39 0.09485786
# 5 40 0.7789147 40 0.31248966
# 74 43 0.7799849 43 0.10910096
# 71 45 0.2847905 45 0.26787813
# 57 46 0.1751268 46 0.17719454
# 25 48 0.1482116 48 0.99607737
# 81 53 0.6304141 53 0.26721208
# 60 58 0.8645449 58 0.96920881
# 30 59 0.6401010 59 0.67371223
# 75 61 0.8806190 61 0.69882454
# 63 64 0.3287773 64 0.36918946
# 19 70 0.9240745 70 0.11350771