アプリケーションを Google App Engine コマンドラインにデプロイしています。GAE にアプリを正常にデプロイした後でアプリケーションにアクセスしようとすると (管理者ログは、新しいバージョンが正常にデプロイされたことを示しています)、Eclipse Juno から appengine プラグインを使用してアプリをデプロイすると、サーブレットに正常にアクセスできます。私はMac OSXを使用していますが、index.htmlに正常にアクセスできます。私の appengine-web.xml は次のようになります
<?xml version="1.0" encoding="utf-8"?>
<appengine-web-app xmlns="http://appengine.google.com/ns/1.0">
<application>my-app-id</application>
<version>1</version>
<threadsafe>true</threadsafe>
<system-properties>
<property name="java.util.logging.config.file" value="WEB-INF/logging.properties"/>
</system-properties>
</appengine-web-app>