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次のようなデータフレームがあります。

df <- data.frame(Site=rep(paste0('site', 1:5), 50),
           Month=sample(1:12, 50, replace=T),
           Count=(sample(1:1000, 50, replace=T)))

すべてのサイトで、カウントが常に最大月間カウントの5%未満であるサイトを削除したいと思います。

すべてのサイトの最大月間カウントは次のとおりです。

library(plyr)
ddply(df, .(Month), summarise, Max.Count=max(Count))

1のカウントがsite5に割り当てられている場合、そのカウントは常にすべてのサイトの最大月間カウントの5%未満です。したがって、site5を削除したいと思います。

df$Count[df$Site=='site5'] <- 1

ただし、site2に新しい値を割り当てた後、そのカウントの一部は最大月間カウントの5%未満であり、その他は5%を超えています。したがって、site2を削除したくありません。

df$Count[df$Site=='site2'] <- ceiling(seq(1, 1000, length.out=20))

データフレームをサブセット化して、カウントが常に最大月間カウントの5%未満であるサイトを削除するにはどうすればよいですか?質問が不明な場合はお知らせください。修正します。

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data.table解決策:

require(data.table)
set.seed(45)
df <- data.frame(Site=rep(paste0('site', 1:5), 50),
       Month=sample(1:12, 50, replace=T),
       Count=(sample(1:1000, 50, replace=T)))
df$Count[df$Site=='site5'] <- 1

dt <- data.table(df, key=c("Month", "Site"))
# set max.count per site+month
dt[, max.count := max(Count), by = list(Month)]
# get the site that is TRUE for all months it is present
d1 <- dt[, list(check = all(Count < .05 * max.count)), by = list(Month, Site)]
sites <- as.character(d1[, all(check == TRUE), by=Site][V1 == TRUE, Site])

dt.out <- dt[Site != sites][, max.count := NULL]
#       Site Month Count
#   1: site1     1   939
#   2: site1     1   939
#   3: site1     1   939
#   4: site1     1   939
#   5: site1     1   939
#  ---                  
# 196: site2    12   969
# 197: site2    12   684
# 198: site2    12   613
# 199: site2    12   969
# 200: site2    12   684
于 2013-03-14T11:22:29.183 に答える
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これがplyr解決策です:

## df2$test is true if Count >= max(Count)*0.05 for this month
df2 <- ddply(df, .(Month), transform, test=Count>=(max(Count)*0.05))
## For each site, test$keep is true if at least one count is >= max(Count)*0.05 for this month
test <- ddply(df2, .(Site), summarise, keep=sum(test)>0)
## Subsetting
sites <- test$Site[test$keep]
df[df$Site %in% sites,]
于 2013-03-14T11:36:15.057 に答える