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Web ベースの R コンパイラを探しています。
まあ、自分のサーバーにインストールできるならRstudioサーバーがいいと思います。Web ブラウザーで Rstudio デスクトップとほぼ同じインターフェイスが表示されます。
http://www.rstudio.com/ide/
R コードを実行する特定の Web アプリケーションを開発したいだけの場合は、Shiny を参照することもできます。
http://www.rstudio.com/shiny/