Gene Ontology 用語を使用して、Uniprot で関連するシーケンスを取得したいと考えています。手動で行うのは簡単ですが、Pythonを使用して実現したいと考えています。誰かがそれにアイデアを持っていますか？たとえば、GO:0070337 があり、すべての検索結果を fasta ファイルにダウンロードしたいとします。ありがとう！
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UniProt が提供する残りのインターフェイスを使用します。要件 (GO 用語、種、ファイル形式など) を使用して検索クエリを作成するだけです。
このクエリは、fasta 形式でレビューされていないタンパク質結合の GO Term を持つすべてのヒトタンパク質を提供します。 http://www.uniprot.org/uniprot/?query=%28go%3A%22protein+binding+%5B0005515%5D%22+AND+organism%3A%22Homo+sapiens+%5B9606%5D%22%29+AND+レビュー%3Ano&sort=score&format=fasta
詳細については、http: //www.uniprot.org/faq/28をご覧ください。
于 2013-03-20T11:01:56.210 に答える