Windows XP で、R 2.15.3 に更新し、すべてのライブラリを更新した後、BioConductor から "oligo" パッケージを読み込めなくなりました。
再作成するには:
source("http://bioconductor.org/biocLite.R") #install the BioC installer
biocLite("oligo") #download and install the oligo package
library("oligo") #attempt to load
次のエラーが発生します。
Error in inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...) :
unable to load shared object 'C:/Program Files/R/R-2.15.3/library/affxparser/libs/i386/affxparser.dll':
LoadLibrary failure: The specified procedure could not be found.
それが言及しているファイル「C:/Program Files/R/R-2.15.3/library/affxparser/libs/i386/affxparser.dll」は、本来あるべき場所にあります。
sessionInfo() は以下を返します:
R version 2.15.3 (2013-03-01)
Platform: i386-w64-mingw32/i386 (32-bit)
locale:
[1] LC_COLLATE=English_United States.1252
[2] LC_CTYPE=English_United States.1252
[3] LC_MONETARY=English_United States.1252
[4] LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=English_United States.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] Biobase_2.18.0 oligoClasses_1.20.0 BiocGenerics_0.4.0
loaded via a namespace (and not attached):
[1] affyio_1.26.0 BiocInstaller_1.8.3 Biostrings_2.26.3
[4] bit_1.1-10 codetools_0.2-8 ff_2.2-11
[7] foreach_1.4.0 GenomicRanges_1.10.7 IRanges_1.16.6
[10] iterators_1.0.6 parallel_2.15.3 stats4_2.15.3
[13] tools_2.15.3 zlibbioc_1.4.0
.libPaths() は以下を返します:
[1] "C:/Program Files/R/R-2.15.3/library"
[2] "C:/Program Files/RStudio/R/library"