S4クラスのS3メソッドとして定義するas.matrix
か、S3メソッドとして定義すると、たとえば、すぐに使用できることに気付きました。S4メソッドとして定義されている場合、これは機能しません。as.data.frame
lm (formula, objS4)
prcomp (object)
メソッドがS3メソッドとS4メソッドのどちらとして定義されているかが重要なのはなぜですか?
例as.data.frame
:
setClass ("exampleclass", representation (x = "data.frame"))
object <- new ("exampleclass", x = iris)
setMethod ("as.data.frame", signature="exampleclass", definition= function (x, ...) x@x )
## [1] "as.data.frame"
as.data.frame (object)
## Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
## 1 5.1 3.5 1.4 0.2 setosa
## 2 4.9 3.0 1.4 0.2 setosa
## 3 4.7 3.2 1.3 0.2 setosa
## ...snip...
lm (Petal.Length ~ Petal.Width, object)
## error in as.data.frame.default(data) :
## cannot coerce class 'structure("exampleclass", package = ".GlobalEnv")' into a data.frame
as.data.frame.exampleclass <- function (x, ...) x@x
lm (Petal.Length ~ Petal.Width, object)
## Call:
## lm(formula = Petal.Length ~ Petal.Width, data = object)
##
## Coefficients:
## (Intercept) Petal.Width
## 1.084 2.230
データから構築された環境で式が評価された場合にのみ強制が発生する状況は少し複雑になる可能性があるためlm
、同じ動作のより単純なケースを次に示します。
setMethod ("as.matrix", signature="exampleclass", definition= function (x, ...) as.matrix (x@x[, 1:4]) )
prcomp (object)
## error in as.vector(data) :
## No method to coerce this S4 class into a vector
as.matrix.exampleclass <- function (x, ...) as.matrix (x@x [, 1:4])
prcomp (object)
## Standard deviations:
## [1] 2.0562689 0.4926162 0.2796596 0.1543862
##
## Rotation:
## PC1 PC2 PC3 PC4
## Sepal.Length 0.36138659 -0.65658877 0.58202985 0.3154872
## Sepal.Width -0.08452251 -0.73016143 -0.59791083 -0.3197231
## Petal.Length 0.85667061 0.17337266 -0.07623608 -0.4798390
## Petal.Width 0.35828920 0.07548102 -0.54583143 0.7536574
ここでstats:::prcomp.default
は、と呼ばれ、プレーンで始まりますx <- as.matrix (x)
。これは上記のS4定義では失敗しますが、S3定義では機能します。