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Ubuntu 12.10 AMD64 で 64 ビット R を実行しています。最近、システムに 8 GB のメモリを追加して、合計 12 GB にしました。しかし、(単一の R セッションの) メモリ使用量が 4GB を超えるたびに、R がエラーを表示することに気付きました。6 つの R セッションを並行して実行すると、それぞれが最大 3 GB のメモリを消費し、全体のメモリ使用量は最大 11 GB に増加しました。ただし、1 つの R セッションで 4GB を超える容量を使用することはできません! 大規模なデータ セットでランダム フォレスト モデルをトレーニングする必要があり、単一の R セッションで 4 GB を超える必要があります。

アップデート：

R> sessionInfo()

R version 2.15.1 (2012-06-22)
Platform: x86_64-pc-linux-gnu (64-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods  
[7] base     

loaded via a namespace (and not attached):
[1] tools_2.15.1

更新 2:

$ ulimit -a
core file size          (blocks, -c) 0
data seg size           (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority             (-e) 0
file size               (blocks, -f) unlimited
pending signals                 (-i) 92787
max locked memory       (kbytes, -l) 64
max memory size         (kbytes, -m) unlimited
open files                      (-n) 1024
pipe size            (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues     (bytes, -q) 819200
real-time priority              (-r) 0
stack size              (kbytes, -s) 8192
cpu time               (seconds, -t) unlimited
max user processes              (-u) 92787
virtual memory          (kbytes, -v) unlimited
file locks                      (-x) unlimited
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2 に答える 2

1

特定のプロセスを 4G に制限するプロセス制限が設定されていると思われます。

ulimit -aメモリに関連する無制限でない値を探してみてください。

また、メモリ制限に関するエントリについて、ファイル/etc/security/limits.confとすべてのファイルを調べます。/etc/security/limits.d/

具体的には、次の 2 つです。

data
as

man limits.confPAM で適用できるクォータ については、を参照してください。

于 2013-03-24T17:14:23.480 に答える
0

Windows OS では、既定で、R は 32 ビット バージョンと 64 ビット バージョンの両方をインストールします。ただし、Linux はそうではないようです。RStudio などの IDE を使用している場合、インストールされている場合は 32 ビット バージョンを指します。これは、Rstudio の設定で変更できます。

于 2013-03-24T16:45:43.247 に答える